结论：国有土地使用证、建设规划许可证与原始档案面积不一致的情况，在特定条件下可以作为证据使用，但能否直接用于起诉并达到预期效果，需结合具体案件情况、证据链完整性及法律规定综合判断。以下从不同角度详细分析：
一、证据效力分析
证据种类与形式
国有土地使用证、建设规划许可证属于行政机关颁发的权属证书或审批文件，属于公文书证，具有较高的证明力。原始档案（如土地登记簿、规划审批档案）属于书证，其证明力需结合形成时间、保存完整性等因素判断。
法律依据：根据《民事诉讼法》第66条，证据包括书证、物证等，公文书证的证明力一般大于其他书证。
不一致的可能原因
- 行政机关错误：如登记或审批时数据录入错误、测量误差等。
- 后续变更未更新：如土地面积因征收、分割等变更，但未及时办理变更登记。
- 历史遗留问题：早期登记标准与现行标准不一致，或档案保管不善导致信息缺失。
建议：需通过行政机关出具的书面说明、测量报告等补强证据，证明不一致的原因。
二、起诉作证的条件与限制
直接起诉的局限性
若仅以“面积不一致”为由起诉，可能因缺乏具体诉求（如确认权属、赔偿损失）或证据链不完整被驳回。需明确：
- 起诉对象：是行政机关（如要求更正登记）、相对方（如相邻权纠纷）还是其他主体？
- 诉讼请求：是要求确认面积、撤销错误证件，还是主张因面积差异导致的损失？
示例：若因面积差异导致拆迁补偿减少，可起诉拆迁方或行政机关，要求按实际面积补偿。
证据链的完整性
需提供其他证据佐证，如：
- 第三方测量机构出具的面积鉴定报告；
- 历史交易合同、纳税记录等证明实际使用面积；
- 行政机关承认错误的书面材料（如更正登记申请回执）。
法律依据：根据《民事诉讼法解释》第104条，能够相互印证的证据链方可作为认定事实的依据。
三、不同场景下的处理建议
行政诉讼场景
若认为行政机关颁发的证件错误，可提起行政诉讼，要求撤销或更正。需注意：
- 起诉期限：自知道或应当知道行政行为之日起6个月内提出（《行政诉讼法》第46条）；
- 前置程序：部分地区要求先申请行政复议（《行政复议法》第23条）。
示例：发现建设规划许可证面积与实际不符，可先向规划部门申请更正，未获答复后再起诉。
民事纠纷场景
若因面积差异引发合同纠纷（如房屋买卖、租赁），可：
- 以“重大误解”或“欺诈”为由主张撤销合同（《民法典》第147条、第148条）；
- 要求对方按实际面积履行义务或赔偿损失。
示例：购房后发现土地使用证面积小于合同约定，可起诉卖方承担违约责任。
刑事举报场景
若怀疑面积差异涉及伪造证件、诈骗等犯罪，可向公安机关报案，但需提供初步证据（如伪造痕迹、利益关联证明）。
四、风险提示与操作建议
风险提示
- 行政诉讼中，法院可能以“属于行政机关自由裁量权范围”为由驳回诉求；
- 民事诉讼中，若对方能证明面积差异系合法变更（如经规划部门批准），可能败诉。
操作建议
- 第一步：向颁发证件的行政机关申请信息公开，获取登记依据；
- 第二步：委托专业机构测量面积，形成鉴定报告；
- 第三步：根据纠纷类型选择诉讼路径，并准备完整证据链。
总结：面积不一致的证件可作为证据，但需结合具体纠纷类型、证据链完整性及法律规定综合运用。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体案件情况。