公司以未完成指标扣罚工资是否合法，需分情况讨论：

1. 若劳动合同或公司规章制度中有明确约定：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定劳动报酬、工作条件等事项。若劳动合同中明确规定了未完成工作指标时的工资扣罚条款，且该条款不违反法律、行政法规的强制性规定，也不存在显失公平、欺诈、胁迫等情形，那么该条款是有效的，公司可以依据此条款扣罚工资。
   • 但需注意：即使劳动合同中有约定，扣罚的工资数额也不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。这是为了保护劳动者的基本生活需求，防止用人单位过度扣罚工资。

2. 若劳动合同或公司规章制度中无明确约定：

   • 在这种情况下，公司以未完成指标为由扣罚工资可能缺乏法律依据。根据《中华人民共和国劳动法》的规定，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。若公司未经劳动者同意，擅自扣罚工资，可能构成违法行为。
   • 劳动者权益保护：若公司违法扣罚工资，劳动者有权向当地劳动监察部门投诉，要求公司补发被扣罚的工资，并可能获得相应的赔偿。同时，劳动者也可以依法向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。

3. 特殊情况下的考虑：

   • 如果未完成指标是由于不可抗力因素（如自然灾害、政策调整等）导致的，且劳动者已经尽到了合理的努力，那么公司扣罚工资可能缺乏合理性。在这种情况下，劳动者可以与公司协商，寻求合理的解决方案。
   • 另外，如果公司扣罚工资的行为存在恶意或歧视性，如针对特定员工或群体进行扣罚，那么该行为可能构成违法行为，劳动者有权依法维权。

建议：

• 对于劳动者而言，在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于工资扣罚的约定，确保自己的权益不受侵害。
• 若公司存在违法扣罚工资的行为，劳动者应保留相关证据（如工资条、扣罚通知等），及时向劳动监察部门投诉或申请劳动争议仲裁。
• 对于公司而言，应制定合理的绩效考核制度，明确工资扣罚的条件和标准，并确保这些制度和标准符合法律法规的规定。同时，在扣罚工资前，应与劳动者进行充分沟通，确保扣罚行为的合理性和合法性。

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