公司间代发工资主要涉及以下规定和要点：

1. 合法性基础
   公司间代发工资需基于合法有效的委托关系。根据《中华人民共和国民法典》第九百一十九条，委托合同是委托人和受托人约定，由受托人处理委托人事务的合同。因此，代发工资的公司（受托方）需与实际用工单位（委托方）签订书面委托协议，明确双方权利义务，包括代发范围、金额、时间、违约责任等。

2. 税务合规要求

   • 个人所得税代扣代缴：根据《中华人民共和国个人所得税法》第九条，支付工资的单位（即代发方）需以实际用工单位名义代扣代缴个人所得税，并在次月15日前向税务机关申报缴纳。
     
   • 企业所得税处理：若代发方与用工单位存在关联关系，需注意税务机关对转移利润的审查。代发费用应按独立交易原则定价，避免被认定为通过代发工资规避企业所得税。
     
   • 发票与凭证：用工单位向代发方支付费用时，需取得合法发票作为税前扣除凭证。代发方需按“生活服务-商务辅助服务”开具增值税发票（税率6%或3%，视纳税人身份而定）。

3. 劳动关系与社保义务

   • 劳动关系认定：代发工资不改变用工单位与劳动者之间的劳动关系。根据《关于确立劳动关系有关事项的通知》（劳社部发〔2005〕12号），劳动关系认定需结合用工管理、工资支付、社保缴纳等综合判断。代发工资仅是支付方式的变更，不影响用工单位承担劳动法义务（如签订劳动合同、缴纳社保、支付经济补偿等）。
     
   • 社保缴纳主体：社保仍由实际用工单位缴纳，代发方无义务为劳动者缴纳社保。若代发方与用工单位混同用工（如共用管理人员、办公场所），可能被认定为共同用人单位，需承担连带责任。

4. 资金安全与风险防控

   • 资金划转合规：代发方需确保工资资金来源合法，避免涉及洗钱、非法集资等风险。建议通过银行专用账户划转工资，并留存完整支付记录。
     
   • 数据保护义务：代发方处理劳动者个人信息（如身份证号、银行账号）时，需遵守《中华人民共和国个人信息保护法》要求，取得劳动者同意并采取必要安全措施，防止数据泄露。
     
   • 违约责任约定：委托协议中应明确代发方未按时足额支付工资的违约责任（如赔偿劳动者损失、支付违约金等），以及用工单位未及时提供资金导致代发方垫付的追偿权。

5. 特殊情形处理

   • 跨地区代发：若用工单位与代发方不在同一地区，需注意地方性规定（如最低工资标准、社保缴费基数差异）。建议按劳动者实际工作地标准执行，避免劳动争议。
     
   • 集团内部代发：集团公司内部代发工资时，需确保子公司或关联公司具备独立用工主体资格，避免因“逆向劳务派遣”被认定为规避劳动法义务。

建议：若您所在公司涉及代发工资安排，建议提前审查委托协议条款、税务合规性及劳动关系认定风险。如有具体操作疑问，可直接向我咨询，我将结合您所在行业及地区政策提供针对性建议。