结论概述：稻城亚丁景区设卡收费是否符合法定程序，需结合具体法律条款和事实情况综合判断。从现有新闻背景来看，景区设卡收费行为存在争议，且未正面回应“截断省道收费”的质疑，其合法性有待进一步查证。以下从多个维度进行详细分析。
一、法律定性及可能涉及的法律条文
公路法相关规定：
- 根据《中华人民共和国公路法》第九条：“禁止任何单位和个人在公路上非法设卡、收费、罚款和拦截车辆。”若稻城亚丁景区未经合法程序，擅自截断省道并设卡收费，则可能违反此规定。
- 同时，该法第四十四条规定：“任何单位和个人不得擅自占用、挖掘公路。因修建铁路、机场、电站、通信设施、水利工程和进行其他建设工程需要占用、挖掘公路或者使公路改线的，建设单位应当事先征得有关交通主管部门的同意；影响交通安全的，还须征得有关公安机关的同意。”景区若因建设需要占用省道，亦需遵循此程序。
价格法相关规定：
- 根据《中华人民共和国价格法》第十八条：“下列商品和服务价格，政府在必要时可以实行政府指导价或者政府定价：（一）与国民经济发展和人民生活关系重大的极少数商品价格；（二）资源稀缺的少数商品价格；（三）自然垄断经营的商品价格；（四）重要的公用事业价格；（五）重要的公益性服务价格。”景区摆渡车服务若属于上述范畴，其定价需遵循政府指导价或政府定价程序。
- 若景区未经合法定价程序，擅自设定收费标准，则可能违反价格法相关规定。
自然保护区管理条例：
- 稻城亚丁作为世界生物圈保护区和国家级自然保护区，其管理需遵循《中华人民共和国自然保护区条例》等相关规定。若景区为保护生态环境，限制社会车辆进入，并采取摆渡车等交通方式，需确保此措施合法、合理且必要。
二、新闻背景中的事实与法律分析
景区设卡收费行为：
- 新闻背景中提到，稻城亚丁景区被自驾博主质疑截断省道收费，且景区未正面回应此质疑。若景区确实存在截断省道并设卡收费的行为，且未经合法程序批准，则可能违反公路法相关规定。
景区管理规定与实际情况：
- 景区发布的情况通报中提到，禁止社会车辆违规进入景区，并强调了生态环境保护和道路安全隐患等问题。然而，通报中未提及设卡收费的合法性依据，也未说明收费标准是否经过合法定价程序。
- 景区工作人员称省道已经纳入了风景名胜区的旅游道路规划里面，但纳入规划并不等于获得设卡收费授权。景区需提供合法文件证明其设卡收费的合法性。
政府及发改部门的回应：
- 稻城县政府办回复网友留言称正在处理相关问题，后续将回复办理结果。这表明政府已关注到此事，并正在进行调查。
- 稻城县发展和改革局工作人员表示已有联合工作组在展开相关工作，但具体定价权限和程序尚不明确。这表明发改部门也在关注此事，并可能参与后续的调查和处理。
三、可能的法律后果及对公众的启示
法律后果：
- 若景区设卡收费行为被认定为违法，则可能面临行政处罚，包括罚款、责令改正等。
- 若景区收费行为给游客造成损失，游客有权要求景区承担赔偿责任。
对公众的启示：
- 公众在遇到类似情况时，应保留相关证据，如收费凭证、照片、视频等，以便在需要时维护自己的合法权益。
- 公众应了解相关法律法规，增强法律意识，避免在不知情的情况下遭受损失。
四、建议与措施
景区方面：
- 景区应尽快正面回应“截断省道收费”的质疑，提供合法文件证明其设卡收费的合法性。
- 景区应确保收费标准经过合法定价程序，并公开透明地告知游客。
- 景区应加强与政府及发改部门的沟通协作，共同维护良好的旅游秩序。
政府及发改部门方面：
- 政府应加快调查进度，尽快查明事实真相，并依法作出处理决定。
- 发改部门应明确景区摆渡车服务的定价权限和程序，确保定价合法、合理且透明。
- 政府及发改部门应加强对景区的监管力度，防止类似事件再次发生。
综上所述，稻城亚丁景区设卡收费是否符合法定程序需结合具体法律条款和事实情况综合判断。从现有新闻背景来看，景区设卡收费行为存在争议且未正面回应质疑，其合法性有待进一步查证。建议景区尽快提供合法文件证明其设卡收费的合法性，并加强与政府及发改部门的沟通协作；同时，政府及发改部门也应加快调查进度并依法作出处理决定。