关于公司的全勤奖和安全奖能否算在底薪内的问题，结论如下：
全勤奖和安全奖的性质：
- 全勤奖和安全奖均属于奖金范畴，是用人单位为激励员工保持全勤或遵守安全规定而设立的奖励制度。它们基于员工的额外良好表现（如全勤、无安全事故等）而给予，具有奖励性质。
- 底薪则是劳动者在正常出勤、提供正常劳动的情况下应得的基本劳动报酬，旨在保障劳动者的基本生活。
全勤奖和安全奖能否算在底薪内的分析：
- 一般情况下的不合法性：
- 若未明确约定且可能损害劳动者权益，将全勤奖和安全奖算在底薪里通常被视为不合法。因为底薪是劳动者应得的基本报酬，而全勤奖和安全奖是对额外良好表现的奖励，将两者混为一谈可能导致劳动者在未能获得奖励但正常出勤时，无法获得足额的基本报酬。
- 特殊约定下的合法性：
- 如果用人单位与劳动者在劳动合同中有明确约定，将全勤奖和安全奖纳入底薪的构成部分，并且该约定不违反当地最低工资标准等法律法规规定，那么这种做法是合法的。例如，当地月最低工资标准是2000元，即使全勤奖和安全奖算在底薪里，劳动者正常出勤拿到的底薪也不低于2000元，这种约定在法律上是被认可的。
用人单位的自主权与义务：
- 根据《劳动法》的规定，单位可以根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平。然而，这种自主权并非无限制的，用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬的规章制度时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
- 用人单位应在劳动合同中明确说明底薪的构成，包括是否包含全勤奖和安全奖，以避免潜在的纠纷。
建议与实践：
- 为了避免劳动争议，建议用人单位在劳动合同中明确约定底薪的构成及全勤奖、安全奖的计算方式。
- 全勤奖和安全奖最好与基本工资单列，以更清晰地体现员工的收入构成。
- 如果劳动者认为用人单位关于全勤奖、安全奖和底薪的设置侵害了自身权益，可以与用人单位协商沟通；协商不成的，可向劳动监察部门投诉或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
总结：全勤奖和安全奖能否算在底薪内，取决于劳动合同中的具体约定以及是否符合相关法律法规的要求。用人单位应确保其薪酬制度既符合法律规定，又能够保障劳动者的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。