核心结论：当甲乙方结算超出合同额时，可分以下几种情况处理：

1. 合同有明确约定
   若合同中已约定“结算金额可超出合同额”或“按实际发生量结算”等条款，则超出部分通常视为双方合意变更，可直接按约定执行。例如：

   • 合同约定“工程量按实际完成量结算”，且施工过程中双方未对工程量提出异议，则超出部分应支付；
     
   • 合同约定“单价固定，工程量按实调整”，则超出合同额的部分仅需按实际工程量乘以单价结算。
     建议：立即核对合同条款，确认是否有类似约定，并留存施工过程中的签证单、变更单等证据。

2. 合同无明确约定，但存在合法变更
   若合同未约定超出部分的处理方式，但实际履行中存在以下情形，超出部分仍可能被支持：

   • 双方书面确认：如通过补充协议、会议纪要、邮件等方式明确同意增加工程量或调整价格；
     
   • 设计变更或业主指令：因发包方（甲方）或第三方（如设计单位、政府）要求变更导致工程量增加，且承包方（乙方）已按要求施工；
     
   • 不可抗力或情势变更：如因自然灾害、政策调整等导致成本增加，双方可协商调整价款。
     建议：收集变更相关的书面文件（如变更通知、签证单）、沟通记录（如微信、邮件）等证据，证明变更的合法性。

3. 合同无约定且无合法变更，可能构成违约或不当得利
   若超出部分既无合同依据，也无合法变更理由，可能涉及以下法律问题：

   • 甲方角度：若乙方擅自增加工程量或提高单价，甲方有权拒绝支付超出部分，并可要求乙方按原合同履行；
     
   • 乙方角度：若甲方未同意变更却要求乙方施工，乙方可主张“表见代理”或“情势变更”要求支付，但需承担较高举证责任；
     
   • 风险：若双方均无法证明变更的合法性，可能被认定为“无效变更”，超出部分可能被要求返还（如构成不当得利）或按原合同结算。
     建议：立即停止争议部分的施工，通过书面方式（如律师函）明确立场，并协商解决方案；若协商不成，可依据合同争议解决条款（如仲裁或诉讼）维权。

补充提醒：

• 无论哪种情况，书面证据是关键。务必保留合同、变更单、沟通记录、付款凭证等材料；
  
• 若涉及政府投资项目，还需注意审计风险，超出合同额的部分可能需经财政评审或审计部门确认；
  
• 具体处理需结合合同类型（如施工合同、采购合同）、行业惯例（如建设工程领域通常允许按实调整）等因素综合判断。
  

如有进一步细节（如合同类型、变更原因等），可向我补充说明，我会为您细化分析。