可以提起行政诉讼，但需满足一定条件，且建议先尝试其他解决途径。以下从多个角度进行分析：

提起行政诉讼的条件

1. 存在具体行政行为：资源局耕保科领导不给办理批复手续，这属于行政机关不履行法定职责的具体行政行为（不作为）。只要该批复手续是资源局耕保科依法应当履行的职责，而其无正当理由拒绝办理，就满足了行政诉讼中存在具体行政行为这一要素。例如，农民申请的是符合土地利用总体规划和相关政策规定的用地批复，资源局耕保科却无故拖延或拒绝办理。
2. 与行政行为有利害关系：农民作为申请批复手续的相对人，与资源局耕保科是否办理批复手续有着直接的利害关系。如果批复手续办理成功，农民可能获得相应的土地使用权益等；而拒绝办理则会使农民的权益受到影响，所以农民具备提起行政诉讼的原告资格。
3. 在法定期限内起诉：根据《中华人民共和国行政诉讼法》的规定，公民、法人或者其他组织直接向人民法院提起诉讼的，应当自知道或者应当知道作出行政行为之日起六个月内提出。法律另有规定的除外。农民需要在规定的期限内提起行政诉讼，否则可能会丧失诉讼权利。

建议先尝试其他解决途径

1. 沟通协商：农民可以先尝试与资源局耕保科领导进行沟通，了解拒绝办理批复手续的具体原因。有可能是因为申请材料不齐全、不符合要求等可补正的情况。通过友好沟通，明确问题所在并加以解决，这样既能节省时间和精力，又能避免不必要的法律纠纷。
2. 向上级部门投诉：如果沟通协商无果，农民可以向资源局的上级主管部门或者同级政府进行投诉。上级部门有权对下级部门的工作进行监督和检查，可能会介入调查并督促资源局耕保科依法办理批复手续。
3. 申请行政复议：行政复议也是一种解决行政争议的有效途径。农民可以在知道资源局耕保科拒绝办理批复手续之日起六十日内向有管辖权的行政复议机关提出行政复议申请。行政复议机关会对该行政行为进行审查，并作出相应的复议决定。如果复议决定维持了原行政行为，农民仍然不服的，还可以再提起行政诉讼。

行政诉讼的流程和注意事项

1. 准备起诉材料：农民需要准备起诉状、身份证明、相关证据材料等。起诉状应当明确被告、诉讼请求、事实和理由等内容。证据材料可以包括申请批复手续的相关文件、与资源局耕保科沟通的记录等，以证明资源局耕保科存在不履行法定职责的行为。
2. 确定管辖法院：行政诉讼一般由最初作出行政行为的行政机关所在地人民法院管辖。农民需要确定有管辖权的法院，并向该法院提交起诉材料。
3. 参与诉讼过程：在诉讼过程中，农民需要积极配合法院的审理工作，按时出庭、提供证据等。同时，也可以委托律师作为代理人参与诉讼，以提高诉讼的胜诉率。

如果遇到资源局耕保科领导不给农民办理批复手续的情况，在满足一定条件下可以提起行政诉讼，但在起诉前建议先尝试沟通协商、向上级部门投诉或申请行政复议等途径解决问题。如果你还有其他关于行政诉讼或土地相关法律问题，欢迎直接向我咨询。