不签劳动合同而只签合作协议是否有效，这主要取决于双方的实际法律关系和协议的具体内容。以下是对此问题的详细分析：
一、双方法律关系的性质
合作关系：
- 如果双方是平等的合作主体，各自独立承担经营风险，按照约定分配利润或承担亏损，且不存在管理与被管理的关系，那么签订合作协议是合法且有效的。例如，两家公司共同开发一个项目，按照约定的比例分享收益，这种情况下合作协议能够明确双方的权利和义务，保障合作的顺利进行。
劳动关系：
- 如果双方实际符合劳动关系的特征，即劳动者接受用人单位的管理，从事有报酬的劳动，且用人单位提供劳动条件，那么即使签订的是合作协议，也可能被认定为事实劳动关系。例如，个人在公司上班，遵守公司的考勤制度，接受公司的工作安排和监督，领取固定的报酬，这种情况下，即便名为合作协议，实则构成劳动关系。
二、合作协议与劳动合同的法律区别与保障
合作协议：
- 合作协议主要受《民法典》等民事法律法规的调整，侧重于合作事项、利益分配、风险承担等方面的约定。
- 在违约时，可以依据合作协议追究对方的违约责任，但通常不提供全面的劳动权益保障，如社会保险、休息休假等。
劳动合同：
- 劳动合同受《劳动法》《劳动合同法》等劳动法律法规的保护，明确规定了双方的权利和义务，包括工资待遇、工作时间、休息休假、社会保险等。
- 如果用人单位不履行劳动合同中的义务，劳动者可以通过劳动仲裁、诉讼等途径来维护自己的权益。
三、合作协议的有效性及风险
- 在特定情况下，如基于具体项目或业务的合作，且双方不打算建立长期的劳动关系，签订合作协议是合适的。但需要确保合作协议的内容合法、有效，并详细规定双方的权利、义务和责任。
- 如果实际上构成劳动关系却只签订了合作协议，可能会引发法律风险。例如，劳动者的权益可能无法得到充分的保障，特别是在社会保险、休息休假等方面。
- 在发生劳动争议时，法院或仲裁机构会根据双方的实际关系来认定是否存在劳动关系，并据此判断合作协议的有效性。
四、建议
如果双方建立劳动关系：
- 应签订正式的劳动合同，以全面保障双方的权益。劳动合同是明确双方权利和义务的重要法律文件，能够避免很多不必要的法律纠纷。
如果仅为具体项目或业务合作：
- 应确保合作协议的内容合法、有效，并详细规定双方的权利义务。合作协议应明确合作事项、利益分配、风险承担等关键条款，以避免合作过程中的纠纷。
在任何情况下：
- 如有疑问或需要法律帮助，可以直接向我咨询。作为专业律师，我能够为你提供全面的法律咨询和专业的法律建议，帮助你解决法律问题。
综上所述，不签劳动合同而只签合作协议的有效性取决于双方的实际法律关系和协议的具体内容。为了避免法律风险，建议根据实际情况选择合适的合同类型，并确保合同内容的合法性和有效性。