在建设工程层层分包的情况下，最终承担责任的主体取决于具体的违法情形和损害后果，一般涉及违法分包方、实际施工人以及发包人等主体。以下从不同角度详细分析：
一、违法分包方的责任
根据《中华人民共和国建筑法》及相关法律法规，建设工程分包必须遵循一定的原则和程序，严禁违法分包。如果总承包单位或专业承包单位将工程分包给不具备相应资质条件的单位，或者分包单位将其承包的工程再分包，这些行为均构成违法分包。
对工程质量问题的责任：
- 如果违法分包导致工程质量问题，违法分包方（即总承包单位或专业承包单位）需要承担相应的法律责任。这包括修复工程、赔偿损失等。
- 实际施工人如果因施工不当导致工程质量问题，也需要承担直接责任。但违法分包方作为工程的管理者，对工程质量负有监督和管理责任，因此不能免除其责任。
对安全事故的责任：
- 在建设工程中，如果发生安全事故，违法分包方同样需要承担责任。这包括对受害者的赔偿、接受行政处罚等。
- 实际施工人如果违反安全规定导致事故发生，也需要承担直接责任。但违法分包方作为工程的安全管理者，对安全事故负有预防和管理责任。
二、实际施工人的责任
实际施工人是指最终实际投入资金、材料和劳力进行工程施工的法人、非法人企业、个人合伙、包工头等民事主体。在层层分包的情况下，实际施工人往往处于最底层，直接负责施工工作。
对工程质量问题的直接责任：
- 实际施工人作为工程的直接实施者，对工程质量负有直接责任。如果工程质量不符合约定或国家标准，实际施工人需要承担修复、返工等责任。
对安全事故的直接责任：
- 实际施工人在施工过程中必须遵守安全规定，确保施工安全。如果因违反安全规定导致事故发生，实际施工人需要承担直接责任，包括赔偿受害者损失、接受行政处罚等。
三、发包人的责任
在特定情况下，发包人也可能需要承担一定的责任。这主要发生在发包人明知或应知违法分包情形而未予以制止或纠正的情况下。
连带责任：
- 如果发包人明知或应知违法分包情形而未采取措施予以制止或纠正，导致工程质量问题或安全事故发生，发包人可能需要与违法分包方、实际施工人承担连带责任。
选任过失责任：
- 如果发包人在选择承包单位时存在过失，如未对承包单位的资质进行审查或审查不严，导致选择了不具备相应资质条件的单位进行承包，发包人也可能需要承担一定的责任。
四、具体案例分析
假设一个建设工程中，总承包单位将工程违法分包给了一个不具备相应资质条件的单位（分包单位），分包单位又将其承包的工程再分包给了一个实际施工人。在施工过程中，由于实际施工人的施工不当导致工程质量问题或安全事故发生。
工程质量问题：
- 实际施工人需要承担直接责任，负责修复工程或赔偿损失。
- 分包单位作为违法分包方，需要承担管理责任，与实际施工人共同承担赔偿责任。
- 总承包单位作为工程的总管理者，也需要承担一定的责任，包括监督和管理不力的责任。
安全事故：
- 实际施工人需要承担直接责任，赔偿受害者损失并接受行政处罚。
- 分包单位和总承包单位作为工程的管理者，需要承担预防和管理不力的责任，可能与实际施工人共同承担赔偿责任或接受行政处罚。
建议：在建设工程中，各方应严格遵守法律法规和合同约定，避免违法分包行为的发生。如果发生纠纷或事故，应及时咨询专业律师，了解自身权利和义务，并采取相应的法律措施维护自身合法权益。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。