关于您提出的“社保缴纳最低基数缴纳是否合法”的问题，这是一个涉及社保缴费基数规定及法律责任的重要问题。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确一个概念：社保缴费基数并非可以随意设定，而是根据职工的工资性收入来确定的。根据相关规定，职工的社保缴费基数一般是按职工上一年度月平均工资（或个人上月工资）来确定。这意味着，职工的工资越高，其社保缴费基数也会相应越高。

同时，为了保障社保制度的公平性和可持续性，相关部门也对缴费基数设置了上限和下限。具体来说：

• 下限：如果职工的缴费基数低于当地规定的最低缴费基数（通常是当地社平工资的60%），那么就需要按照最低缴费基数来缴纳社保。但这里的关键是，这个“最低缴费基数”并非单位可以随意选择的，而是由当地社保部门根据社平工资等因素统一规定的。

• 上限：相应地，如果职工的缴费基数高于当地规定的最高缴费基数（通常是当地社平工资的300%），那么就需要按照最高缴费基数来缴纳社保。

重点来了：单位按照当地社保部门规定的最低缴费基数来缴纳社保，在职工实际工资高于这个最低基数的情况下，是不合法的。因为这样做实际上降低了职工的社保权益，违反了社保缴费基数与职工工资性收入相挂钩的原则。

进一步来说，如果单位长期按照最低基数缴纳社保，而职工的实际工资远高于这个基数，那么职工在享受社保待遇时（如养老金、医疗保险报销等）可能会受到不利影响。此外，这种做法也可能面临法律风险。随着社保审核的日益严格，税务机关和社保部门有权对单位的社保缴费情况进行核查，并要求单位补缴不足部分。

关于员工能否索要赔偿的问题：这取决于当地的法律法规和司法实践。在一些地区，如果单位未依法为劳动者缴纳社会保险费（包括缴费基数不符合法律规定），劳动者在要求单位补缴而单位未在规定时间内补缴的情况下，有权提出解除劳动合同并要求单位支付经济补偿。但在其他地区，可能更倾向于通过补缴或社保管理部门强制征缴的方式来保障劳动者的社保权益，而不直接支持经济补偿的诉求。

综上所述，单位按照社保最低基数缴纳社保，在职工实际工资高于这个基数的情况下，是不合法的。单位应该根据职工的实际工资性收入来确定社保缴费基数，并依法足额缴纳社保费。如果单位存在未足额缴纳社保的情况，职工有权向社保部门或税务机关投诉举报，并要求单位补缴不足部分。