自离时，工资是否会被扣需根据具体情况判断，一般情况下单位不得无故克扣工资，但在特殊情形下，如给单位造成经济损失或未提前通知离职，单位可以合理扣除部分工资。以下从不同角度为你详细分析：
一般情况下的工资支付
根据《中华人民共和国劳动法》第五十条、《中华人民共和国劳动合同法》第三十条以及《工资支付暂行规定》第九条，劳动者提供正常劳动后，用人单位有义务按月以货币形式支付相应的工资报酬。这意味着，即使劳动者选择自行离职（自离），对于其实际工作期间所产生的劳动成果，用人单位也应当按照约定支付工资，不得无故克扣或拖欠。
特殊情形下的工资扣除
给单位造成经济损失：
- 如果劳动者的自离行为给用人单位造成了直接经济损失，且用人单位能够证明损失金额，那么用人单位有权要求劳动者进行赔偿。这种赔偿可以从劳动者的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资低于当地月最低工资标准，则用人单位需按最低工资标准支付。
- 举例：假设你当月工资为5000元，因自离给单位造成了1500元的损失，单位最多只能从你的工资中扣除1000元（即5000元的20%），剩余4000元需支付给你。如果当地最低工资标准为2000元，而扣除损失后剩余工资为3500元（仍高于最低工资标准），则单位应支付你3500元；但如果扣除后剩余工资为1500元（低于最低工资标准），则单位需按最低工资标准2000元支付给你。
未提前通知的代通知金：
- 如果劳动合同中有明确约定，劳动者未提前通知用人单位而擅自离职需要支付相当于一定时间工资的代通知金，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位可以依据约定扣除相应金额。然而，需要注意的是，各地司法实践对于这种约定的效力认定可能存在差异。
- 举例：若劳动合同中约定，员工未提前30天通知离职需支付一个月工资作为代通知金，且该约定合法有效，那么在你自离时，单位有权从你的工资中扣除一个月工资作为代通知金（但需确保扣除后剩余工资不低于最低工资标准）。
工作交接未完成或违反保密义务等：
- 员工未完成工作交接可能导致公司业务受阻或产生额外成本，用人单位可要求员工承担因未交接造成的合理损失，但需通过协商或法律途径解决，而非直接扣发工资。
- 若员工离职后泄露商业秘密或违反竞业限制协议，用人单位可通过法律手段追责，但此类情况不直接影响工资发放，若因此造成损失，用人单位可主张赔偿。
劳动者的权益保障
- 用人单位在扣除工资时，必须有明确的法律依据或合同约定，并且要遵循法定程序。如果劳动者认为用人单位克扣工资的行为不合理或不合法，首先可以与用人单位协商解决；协商不成的，可以向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
- 投诉流程：向劳动监察部门投诉时，需提交投诉书、身份证明、劳动关系证明材料等。劳动监察部门将进行监督检查，并责令用人单位限期支付工资、加付赔偿金等。
- 仲裁流程：申请劳动仲裁时，需提交仲裁申请书、身份证明、劳动关系证明材料、工资单等证据。劳动争议申请仲裁的时效期间为一年，从知道或应当知道权利被侵害之日起计算。
综合建议
- 在处理自离后工资问题时，劳动者应先了解相关法律法规和劳动合同条款，明确自己的权利和义务。
- 与用人单位协商是首选，但也要做好准备，必要时采取法律手段维护自身权益。
- 保留好所有相关证据，如聊天记录、通话录音、劳动合同、工资单等，以备不时之需。
总之，自离时工资是否会被扣并非一概而论，而是需要根据具体情况来判断。在任何情况下，用人单位都应遵守法律规定，确保劳动者的合法权益不受侵害。同时，劳动者也应了解自己的权利和义务，在遇到问题时及时寻求法律帮助。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。