工厂实行12小时两班倒制度是否合法需分情况讨论，具体分析如下：

1. 若每日工作时间超过法定标准且未依法安排补休或支付加班费，则违法
   根据《劳动法》第三十六条，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周不超过44小时。若工厂强制要求员工每日工作12小时，且未满足以下条件之一，则属于违法行为：
   

• 安排补休：若因生产经营需要延长工作时间，工厂需在后续安排同等时间的补休；
  
• 支付加班费：若无法安排补休，需按《劳动法》第四十四条规定支付加班费（工作日延长工时支付不低于工资150%的报酬，休息日工作且未补休支付200%，法定节假日支付300%）。
  

例外情形：若工厂因特殊原因（如自然灾害、事故抢修等紧急情况）需临时延长工作时间，且经与工会和劳动者协商后实施，可能不视为违法，但仍需保障劳动者健康并尽快恢复标准工时。

1. 若工厂未保障劳动者休息权或健康权，则违法
   即使支付加班费，若长期实行12小时两班倒导致劳动者休息时间不足（如每日连续工作12小时后仅休息12小时，或每月加班总时长超过36小时），可能违反《劳动法》第三十八条（保障劳动者休息权）及第四十一条（每月加班不得超36小时）的规定，损害劳动者健康权。

员工维权步骤：

1. 收集证据：保留工资条、考勤记录、排班表、加班通知等书面证据，以及同事证言、工作记录等辅助材料，证明工厂存在超时加班或未支付加班费的事实；
   
2. 与工厂协商：向人力资源部门或管理层提出书面异议，要求调整工时、安排补休或支付加班费，并留存协商记录（如邮件、聊天记录）；
   
3. 向劳动监察部门投诉：若协商无果，可向当地劳动保障监察大队举报（可通过12333热线或官网投诉），监察部门将调查并责令工厂整改；
   
4. 申请劳动仲裁：若工厂拒不改正，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，主张加班费、经济补偿等权益（需在知道权益受损之日起1年内提出）；
   
5. 提起诉讼：对仲裁结果不服的，可向法院提起诉讼，通过司法程序维护权益。

温馨提示：若工厂以“自愿加班”为由规避责任，需注意《劳动法》明确规定“用人单位不得强迫或者变相强迫劳动者加班”，员工有权拒绝违法超时加班要求。若因此被解雇，工厂属于违法解除劳动合同，员工可主张赔偿金。

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