结论：领导贪污被抓，职工年终奖是否可以发放，需根据公司的财务状况、年终奖的发放规定以及贪污行为对公司财务的具体影响来综合判断。以下从不同角度进行分析：
公司财务状况：
- 如果公司财务状况良好，且年终奖的发放是基于公司盈利和员工绩效的常规安排，那么即使领导贪污被抓，也不应影响职工年终奖的正常发放。因为年终奖是员工应得的劳动报酬，与个别领导的违法行为无直接关联。
- 如果公司财务状况因领导贪污而受到严重影响，导致资金链断裂或无法支付员工工资及年终奖，那么职工年终奖的发放可能会受到阻碍。但这种情况下，公司仍需尽力保障员工的基本权益，如通过协商、调解或法律途径解决工资及年终奖的支付问题。
年终奖的发放规定：
- 公司应明确年终奖的发放规定，包括发放条件、发放时间、发放方式等。如果规定中未将领导贪污等违法行为作为不发年终奖的理由，那么公司应按照规定发放年终奖。
- 如果公司试图以领导贪污为由拒绝发放年终奖，且该理由不在公司规定或劳动合同约定的范围内，那么这种行为可能构成违法。员工有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，维护自己的合法权益。
贪污行为对公司财务的具体影响：
- 如果领导贪污的款项并未涉及公司用于发放年终奖的资金，那么职工年终奖的发放不应受到影响。
- 如果领导贪污的款项正是公司计划用于发放年终奖的资金，那么公司需要评估剩余资金是否足以支付年终奖。如果不足，公司应与员工协商解决方案，如分期支付、部分支付或以其他形式补偿等。
法律建议：
- 对于员工而言，如果公司拒绝发放年终奖且理由不充分或违法，员工可以首先与公司进行协商，寻求解决方案。如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，要求公司支付应得的年终奖。
- 对于公司而言，应建立健全的财务管理制度和内部控制机制，防止领导贪污等违法行为的发生。同时，公司应明确年终奖的发放规定，并确保规定合法、合理且透明，以避免因年终奖发放问题引发的劳动争议。
可能后果：
- 如果公司违法拒绝发放年终奖，可能面临劳动监察部门的处罚和员工的法律诉讼，这不仅会影响公司的声誉和形象，还可能给公司带来经济损失。
- 如果员工因年终奖发放问题与公司产生争议并提起诉讼或仲裁，这将耗费双方的时间和精力，并可能影响员工的工作积极性和公司的运营效率。
因此，建议公司和员工在年终奖发放问题上保持沟通、协商和合作，共同维护和谐的劳动关系。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。