关于公司代缴社保个人部分的合法性，这确实是一个需要细致分析的问题。首先，我们可以明确一点：公司代缴社保个人部分的合法性，主要取决于公司与个人之间是否存在真实的劳动关系。
一、存在真实劳动关系的情况
如果公司与个人之间建立了合法的劳动关系，那么公司为员工代缴社保（包括个人部分）是法定义务，具有完全的合法性。根据《中华人民共和国社会保险法》的相关规定，用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记，并依法缴纳社会保险费。这包括公司代扣代缴员工个人应承担的社会保险费用。在这种情况下，公司代缴社保个人部分是合法且必要的，也是公司作为用人单位的法定责任。
二、不存在真实劳动关系的情况
如果公司与个人之间不存在真实的劳动关系，而只是单纯应个人要求以公司名义为其代缴社保，这种行为则涉嫌违法违规。具体来说：
法律层面违规：社会保险制度是基于劳动关系设计的，旨在为劳动者提供社会保障。虚构劳动关系进行代缴，扰乱了社会保险的正常参保秩序，违反了《社会保险法》等法律法规的初衷。
行政风险与处罚：社保行政部门有权对这种违规行为进行查处。一旦发现公司存在为非本单位员工代缴社保的情况，社保行政部门可能会对公司采取罚款、警告等行政处罚措施，并要求纠正违规参保行为，退回已经领取的社保待遇。
信用风险：这种违规行为还可能被纳入企业和个人的信用记录，对企业的商业活动和个人社会生活产生诸多不利影响。
权益风险：对于代缴社保的个人而言，由于不存在真实劳动关系，其权益可能无法得到有效保障。特别是在发生工伤、医疗等需要社保赔付的情况下，可能面临认定困难、赔付受阻等问题。
三、特殊情况：代缴社保公司
此外，还有一种特殊情况是代缴社保公司。这类公司的合法性取决于其具体的操作方式和目的：
如果代缴社保公司服务的是灵活就业人员、自由职业者等没有固定工作单位的群体，且这些人员因故无法自行办理社保缴纳手续，同时代缴社保公司依法取得营业执照和相应的资质许可，并严格遵守国家关于社会保险的法律法规和政策规定，那么这种代缴行为是合法的。
如果代缴社保公司通过虚构劳动关系、资质不全或违规经营、违反社保管理制度与规避缴费责任等方式进行代缴，那么这种行为则是违法的。
四、总结与建议
综上所述，公司代缴社保个人部分的合法性完全取决于公司与个人之间是否存在真实的劳动关系。因此，在进行代缴操作前，公司和个人都必须明确这一点。如果存在真实的劳动关系，则可以放心地进行代缴操作；如果不存在劳动关系，则应坚决避免代缴行为，以免触犯法律法规并引发一系列不良后果。同时，对于选择代缴社保服务的个人或企业，也应谨慎选择正规、合法的服务机构，并确保代缴行为符合相关法律法规的要求。