针对您提出的“京牌持有人死亡遗嘱将车牌由朋友继承是否合法”的问题，以下是我的详细解答：

首先，需要明确的是，京牌（小客车指标）本身并不能作为遗产进行继承。京牌是行政许可的一种，由车辆管理部门发放给车主，它并不属于个人财产的范畴，因此不能直接通过遗嘱进行继承。

然而，被继承人生前所拥有的车辆是可以作为遗产进行继承的。在车辆继承的过程中，如果继承人符合一定的条件，是可以通过办理相关手续来继续使用原车牌的。但这里的关键是，继承人必须是与被继承人有法定继承关系的人，如配偶、子女、父母等，或者是被继承人在遗嘱中明确指定的车辆继承人。

现在，我们具体分析您的情况：

1. 遗嘱的效力：

   • 如果被继承人在遗嘱中明确指定了车辆由朋友继承，那么这份遗嘱在车辆继承方面是具有法律效力的。但需要注意的是，遗嘱只能指定车辆的继承，而不能直接指定京牌的继承。

2. 车牌的使用：

   • 即使朋友通过遗嘱继承了车辆，他也不能直接继承京牌。朋友需要按照车辆继承的相关规定，办理车辆过户手续，并在符合一定条件（如名下无本市登记的小客车、具有有效的机动车驾驶证等）的情况下，申请保留原车牌号码用于新车或过户后的车辆。但这一过程并不等同于直接继承京牌。

3. 法律程序与要求：

   • 在整个继承过程中，需要遵循相关的法律法规和程序要求。例如，可能需要办理继承权公证、提供被继承人的死亡证明、亲属关系证明等材料，并前往当地车管所或相关办事窗口提出申请。

综上所述，京牌持有人死亡后，不能通过遗嘱直接将车牌由朋友继承。朋友可以通过遗嘱继承车辆，并在符合相关条件的情况下申请保留原车牌号码，但这并不等同于直接继承京牌。在整个过程中，应确保所有手续合法合规，并遵循相关的法律法规和程序要求。