公司一般无权单方面扣留员工的辞职单，但具体情况需结合辞职单的性质和公司规定来分析。以下从不同角度为你详细解释：

1. 从辞职单的法律性质来看：

   • 辞职单通常是员工向公司表达离职意愿的书面文件，它构成了劳动合同解除的意向通知。一旦员工提交了辞职单，且该辞职单符合法律规定的形式和内容要求（如明确离职日期、原因等），它就具有了一定的法律效力。
   • 公司收到辞职单后，应当进行确认并办理相关离职手续，而不是单方面扣留。扣留辞职单可能阻碍员工正常离职流程的进行，甚至可能引发劳动纠纷。

2. 从公司规定和内部流程来看：

   • 有些公司可能有自己的离职流程和规定，包括辞职单的提交、审批、归档等环节。然而，这些规定应当符合法律法规的要求，不能侵犯员工的合法权益。
   • 如果公司规定中明确要求员工提交辞职单后需经过一定程序（如审批）才能离职，且该程序合法合理，那么公司可以在该程序完成前暂时保管辞职单。但一旦程序完成，公司应当及时将辞职单归还给员工或作为离职档案的一部分进行保存，而不是无限期扣留。

3. 从实际操作和劳动纠纷预防的角度来看：

   • 为了避免劳动纠纷，建议员工在提交辞职单时保留一份复印件或拍照留存，作为自己已经提交辞职单的证据。
   • 如果公司扣留辞职单且拒绝办理离职手续，员工可以与公司进行沟通协商，要求公司按照法律法规和公司规定办理离职手续。如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。

法律建议：

• 如果你已经提交了辞职单但公司拒绝归还或办理离职手续，你可以先与公司进行沟通协商，明确表达自己的离职意愿和要求。
• 如果协商无果，你可以收集相关证据（如辞职单复印件、与公司沟通的记录等）向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
• 在整个过程中，保持冷静和理性，依法维护自己的权益，避免采取过激行为或言语攻击等不当方式。

可能后果：

• 如果公司无正当理由扣留辞职单并拒绝办理离职手续，可能面临劳动监察部门的处罚或劳动仲裁的败诉风险。
• 对于员工来说，如果因为公司扣留辞职单而无法及时离职，可能会影响其下一份工作的入职或造成其他经济损失。因此，建议员工在提交辞职单时做好相关准备和证据留存工作。