针对不合法厂房因历史遗留问题产生的抵押登记、拍卖及过户，若需撤销相关登记，可依据以下法律条款及逻辑展开分析：

1. 《民法典》第三百九十九条（原《物权法》第一百八十四条）——抵押财产的合法性限制
   若厂房本身属于违法建筑（如未取得建设工程规划许可证、未按照规划许可建设等），根据《民法典》第三百九十九条第六项，“依法被查封、扣押、监管的财产”以及“法律、行政法规规定不得抵押的其他财产”不得抵押。违法建筑因违反《城乡规划法》《土地管理法》等强制性规定，属于“不得抵押的财产”，其抵押登记自始无效，可依据此条款主张撤销抵押登记。

2. 《民法典》第一百五十三条——违反法律强制性规定的民事法律行为无效
   若抵押登记行为违反《城乡规划法》第六十四条（未取得建设工程规划许可证的建设处理）或《土地管理法》第七十七条（非法占用土地建设处罚）等强制性规定，抵押合同因违反法律强制性规定而无效。根据《民法典》第一百五十三条，“违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效”，可据此主张抵押登记因基础合同无效而应被撤销。

3. 《民法典》第二百三十二条——物权变动与原因行为的关系
   若厂房因违法被行政机关责令拆除或没收，其物权已因行政处罚而消灭或转移，此时抵押权因抵押物灭失而消灭。根据《民法典》第二百三十二条，“处分依照本节规定享有的不动产物权，依照法律规定需要办理登记的，未经登记，不发生物权效力”。若过户行为未依法办理登记或违反物权变动规则，可主张过户无效并撤销登记。

4. 《行政许可法》第六十九条——行政许可的撤销情形
   若抵押登记或过户登记系行政机关违法作出（如未尽审查义务、超越职权等），可依据《行政许可法》第六十九条，“对不具备申请资格或者不符合法定条件的申请人准予行政许可的，行政机关或者其上级机关可以撤销行政许可”，通过行政复议或行政诉讼主张撤销登记。

实务建议：

• 证据收集：需证明厂房违法性（如行政处罚决定书、规划部门认定文件）、抵押登记或过户程序违法（如登记材料虚假、未履行审查义务）；
  
• 程序选择：可同时提起民事诉讼（确认抵押合同无效）与行政诉讼（撤销登记行为），或通过行政复议先行解决；
  
• 时效注意：行政诉讼需在知道登记行为之日起6个月内提起，民事诉讼需在知道权利受损之日起3年内主张。

总结：撤销登记的核心逻辑是证明登记行为违反法律强制性规定或行政程序违法，需结合具体证据选择适用《民法典》或《行政许可法》相关条款。如有进一步细节需分析，可直接向我咨询。