员工请假做手术，一般情况下是不应该扣工资的，但具体还需根据请假类型和公司规定来判断。以下是从不同角度对此问题的详细分析：

1. 医疗期内的病假：

   • 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工因患病或非因工负伤需要停止工作医疗时，企业应根据员工本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予一定的医疗期。
   • 在医疗期内，员工享有病假工资或疾病救济费，其标准不得低于当地最低工资标准的80%。因此，如果员工请假做手术属于医疗期内的病假，公司是不应该扣工资的，反而需要支付病假工资。

2. 非医疗期内的请假：

   • 如果员工请假做手术不属于医疗期内的病假，比如是因为个人原因（如美容手术等非必需手术）而请假，那么这种情况下的请假可能不被视为病假，公司可能会根据内部规定来处理工资问题。
   • 有些公司可能会规定，非病假性质的请假（如事假）是不支付工资的。但这并不意味着公司可以随意扣减工资，而是需要依据公司内部的规章制度和劳动合同来执行。如果公司规章制度或劳动合同中没有明确规定，那么公司扣减工资的行为可能缺乏法律依据。

3. 公司规定与劳动合同：

   • 公司在制定规章制度时，应遵循法律法规的规定，不得侵犯员工的合法权益。如果公司规章制度中关于请假扣工资的规定与法律法规相抵触，那么该规定是无效的。
   • 劳动合同是员工与公司之间约定权利义务的重要文件。如果劳动合同中明确规定了请假期间的工资支付方式，那么双方应按照劳动合同的约定来执行。

建议：

• 对于员工而言，在请假做手术前，应了解公司的规章制度和劳动合同中关于请假和工资支付的相关规定，以便在请假时能够明确自己的权益。
• 如果公司扣减了员工的工资，员工可以与公司进行沟通协商，要求公司按照法律法规和劳动合同的规定支付工资。如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

可能的法律后果：

• 如果公司违反法律法规或劳动合同的规定扣减员工工资，可能会面临劳动监察部门的处罚或劳动仲裁机构的裁决，要求公司支付被扣减的工资及可能的赔偿金。

总之，员工请假做手术是否扣工资，需要根据具体情况来判断。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。