实行综合工时制的公司，在放假时一般应当带薪，但具体是否带薪还需根据放假性质及法律规定来判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、综合工时制下的带薪休假原则
综合工时制是一种特殊的工作时间制度，它允许在一定周期内（如周、月、季、年）综合计算工作时间，但平均日和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。在综合工时制下，员工享有与标准工时制相同的带薪休假权利，这包括法定节假日、年休假等。
法定节假日：根据《劳动法》的规定，员工在法定节假日享有带薪休假的权利。因此，如果公司放假是因为法定节假日，那么员工应当享受带薪休假。
年休假：员工根据工作年限享有不同天数的年休假，这也是带薪的。如果公司安排员工在年休假期间放假，那么员工同样应当享受带薪休假。
二、非带薪休假的特殊情况
虽然综合工时制下员工一般享有带薪休假权利，但也存在一些特殊情况，公司可能不需要支付带薪休假工资：
员工个人原因导致的休假：如果员工因个人原因（如事假、病假等）需要休假，且这些休假不属于法定节假日或年休假范畴，那么公司可能不需要支付带薪休假工资。但需要注意的是，对于病假，公司通常需要按照法律规定支付病假工资或医疗期工资。
公司经营困难或特殊情况下的休假：在极少数情况下，如果公司因经营困难或遇到不可抗力等特殊情况需要安排员工休假，且这些休假不属于法定节假日或年休假范畴，公司可能与员工协商一致后不支付带薪休假工资。但这种情况需要符合相关法律法规的规定，并且公司需要承担相应的法律责任和风险。
三、法律建议与风险提示
对于员工：如果你所在的公司实行综合工时制，并且在放假时未支付带薪休假工资，你可以先与公司沟通协商，了解放假性质及未支付工资的原因。如果协商无果，你可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
对于公司：公司在安排员工休假时，应当明确休假性质及工资支付情况，避免与员工产生纠纷。如果确实需要安排非带薪休假，应当与公司员工协商一致，并签订书面协议明确双方的权利和义务。同时，公司还需要遵守相关法律法规的规定，确保员工的合法权益不受侵害。
总结来说，实行综合工时制的公司在放假时一般应当带薪，但具体是否带薪还需根据放假性质及法律规定来判断。如果你对此有疑问或遇到相关纠纷，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议和帮助。