结论：若在林地上建厂但国土部门不批准，首先需要明确的是，这种不批准通常是因为该行为可能违反了土地管理、林业保护或城乡规划等相关法律法规。针对这一情况，可以从以下几个角度进行分析和处理：

1. 了解不批准的具体原因：

   • 土地性质与用途：林地属于农用地，根据《土地管理法》等相关规定，农用地转为建设用地需要经过严格的审批程序。如果未经批准擅自改变土地用途，国土部门有权不批准并可能进行处罚。
   • 规划限制：即使土地性质允许转为建设用地，还需符合当地的城乡规划。如果建厂项目与规划不符，也可能导致不批准。
   • 环保要求：建厂项目还需满足环保要求，如未通过环境影响评价，也可能导致国土部门不批准。

2. 合法途径解决：

   • 申请土地用途变更：如果确实需要在林地上建厂，且符合土地利用总体规划和城乡规划，可以向当地国土部门申请土地用途变更，并按照规定程序办理相关手续。
   • 调整项目选址：如果土地用途变更不可行或成本过高，可以考虑调整项目选址，选择符合规划且易于获得批准的土地进行建设。
   • 完善环保手续：确保项目符合环保要求，通过环境影响评价等必要程序，以增加获得批准的可能性。

3. 法律后果与风险防范：

   • 未经批准擅自建设的法律后果：如果未经批准擅自在林地上建厂，可能面临国土部门的处罚，包括责令停止建设、限期拆除、罚款等。同时，还可能因违反环保、规划等法律法规而面临其他处罚。
   • 风险防范：在项目启动前，应充分了解相关法律法规和政策要求，确保项目合法合规。在办理相关手续时，应积极配合国土、环保、规划等部门的工作，提供必要的资料和证明文件。

4. 具体操作建议：

   • 咨询专业律师：在处理此类问题时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。律师可以根据项目具体情况和当地法律法规，为你提供针对性的解决方案。
   • 与相关部门沟通：积极与国土、环保、规划等部门沟通，了解不批准的具体原因和整改要求。根据部门反馈，及时调整项目方案或完善相关手续。
   • 关注政策动态：密切关注当地土地管理、林业保护、城乡规划等方面的政策动态，以便及时调整项目策略并抓住有利时机。

示例说明：假设你计划在某块林地上建厂，但国土部门以土地性质不符为由不批准。此时，你可以先了解该林地的具体土地性质和用途规划，然后咨询专业律师或当地国土部门，了解是否可以通过申请土地用途变更来解决问题。如果变更不可行或成本过高，你可以考虑调整项目选址或寻找其他合适的土地进行建设。在整个过程中，务必确保项目合法合规，避免因违反法律法规而面临不必要的法律风险和损失。

进一步思考：在处理此类问题时，除了关注法律层面的要求外，还应考虑项目可行性、经济效益和社会效益等多方面因素。通过综合评估和权衡利弊，做出更明智的决策。同时，保持与相关部门的良好沟通也是解决问题的关键之一。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。