结论：公司要认定工伤时，员工尚未恢复并不影响工伤认定的申请和进行。工伤认定主要关注的是事故或伤害是否符合工伤认定的条件，而非员工当前的恢复状态。

详细分析：

1. 工伤认定的基本条件：

   • 根据《工伤保险条例》的相关规定，工伤认定主要基于员工在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害，或者因履行工作职责受到暴力等意外伤害等情形。这些条件并不涉及员工是否已经恢复或康复。
   • 因此，即使员工尚未恢复，只要其伤害符合工伤认定的条件，就可以申请工伤认定。

2. 工伤认定的流程：

   • 员工或其近亲属、用人单位在事故伤害发生之日起30日内，可以向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
   • 社会保险行政部门在受理申请后，会进行调查核实，并根据调查结果作出工伤认定的决定。
   • 在这个过程中，员工的恢复状态并不是决定性的因素，而是会关注伤害的事实、原因以及是否符合工伤认定的条件。

3. 未恢复对工伤认定的影响：

   • 员工尚未恢复并不意味着其不能申请工伤认定或影响工伤认定的结果。工伤认定是基于伤害的事实和原因，而非员工的恢复状态。
   • 如果员工因伤害需要长期治疗或康复，这并不影响其工伤认定的申请和进行。在工伤认定后，员工还可以根据相关规定享受工伤保险待遇，包括医疗费用报销、伤残津贴等。

4. 实际操作建议：

   • 如果员工尚未恢复，但已经符合工伤认定的条件，建议尽快向用人单位或社会保险行政部门提出工伤认定申请，以便及时享受工伤保险待遇。
   • 在申请过程中，员工应提供相关的医疗证明、事故报告等证据材料，以支持其工伤认定的申请。
   • 如果员工在工伤认定过程中遇到任何问题或困难，可以及时咨询专业律师或相关机构，以获取更详细的法律指导和帮助。

总结与建议： 公司要认定工伤时，员工尚未恢复并不构成障碍。工伤认定主要关注的是伤害的事实和原因是否符合工伤认定的条件。因此，如果员工符合工伤认定的条件，即使尚未恢复，也可以申请工伤认定并享受相应的工伤保险待遇。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。