迟到扣工资的计算方式并非简单按基本工资来算，而是需根据公司的具体规章制度以及劳动合同的约定来确定。以下从几个方面为你详细分析：

1. 公司规章制度：

   • 许多公司会在其规章制度中明确规定迟到的处理方式，包括扣工资的标准。这些规定通常会考虑到迟到的时长、频率以及是否对公司造成了实际损失等因素。
   • 例如，有些公司可能规定迟到半小时以内扣当天工资的10%，迟到半小时以上扣当天工资的20%等。但这样的规定必须合法合理，不能违反劳动法的相关规定。

2. 劳动合同约定：

   • 劳动合同是劳动者与用人单位之间确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。如果劳动合同中明确约定了迟到扣工资的方式和标准，那么双方应按照合同约定执行。
   • 但同样，劳动合同中的约定也不能违反劳动法的强制性规定，如不能约定过低的工资标准或过重的扣款比例。

3. 劳动法相关规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动法》及相关规定，用人单位不得随意克扣劳动者的工资。扣工资必须基于合法、合理的原因，并且扣款比例不能过高，以免损害劳动者的合法权益。
   • 如果公司因迟到而扣工资，必须确保扣款行为符合法律法规的规定，否则劳动者有权向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。

4. 实际操作建议：

   • 对于劳动者而言，如果公司因迟到而扣工资，应首先查看公司的规章制度和劳动合同中的相关约定，了解扣款的具体标准和原因。
   • 如果认为公司的扣款行为不合理或违法，可以与公司进行协商，要求公司纠正错误的扣款行为。
   • 如果协商无果，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁，以维护自己的合法权益。

举例说明：假设某公司规定迟到半小时以内扣当天工资的5%，迟到半小时以上扣当天工资的10%。如果某员工的基本工资是200元/天，他某天迟到了40分钟，那么根据公司的规定，他当天应被扣的工资是200元的10%，即20元。但需要注意的是，这个扣款比例和方式必须是在公司的规章制度和劳动合同中明确约定的，并且符合劳动法的相关规定。

总结与建议：迟到扣工资并非简单按基本工资来算，而是需综合考虑公司的规章制度、劳动合同的约定以及劳动法的相关规定。如果你对公司的扣款行为有疑问或不满，建议直接向我咨询，我会根据你的具体情况为你提供专业的法律建议。