结论：小区550多户设计只有100多个车位是否合法，不能一概而论，需要结合当地的规划要求、小区的具体规划情况以及相关法律法规来综合判断。以下从几个关键角度进行分析：
当地规划要求：
- 不同地区对于小区车位的配比有不同的规划要求。这些要求通常会考虑到小区的规模、居住人口数量、周边交通状况等因素。
- 如果当地规划明确规定了小区车位与户数的最低配比标准，而该小区的车位数量未达到这一标准，那么该小区的车位设计可能就不合法。
小区具体规划情况：
- 小区的车位设计需要符合其整体的规划方案。这包括车位的布局、数量、类型（如地面车位、地下车位等）等。
- 如果小区的车位设计在规划阶段就未得到相关部门的批准，或者在实际建设过程中与规划方案不符，那么该小区的车位设计也可能存在问题。
相关法律法规：
- 根据《中华人民共和国民法典》等相关法律法规，小区的车位属于小区的配套设施之一，其设计应当满足业主的合理需求。
- 如果小区的车位数量严重不足，导致业主无法正常使用车辆或者引发其他纠纷，那么该小区的车位设计可能违反了相关法律法规的精神。
法律建议：
- 如果您作为小区业主，对车位数量有疑问或不满，首先可以查阅小区的规划文件和相关法律法规，了解当地对于小区车位配比的具体要求。
- 如果发现小区的车位设计确实存在问题，您可以向小区的物业公司或开发商提出异议，并要求其进行整改或提供合理的解决方案。
- 如果协商无果，您可以考虑向当地的规划部门或房地产管理部门投诉，或者通过法律途径维护自己的合法权益。
可能后果：
- 如果小区的车位设计确实不合法，且未得到及时整改，那么可能会面临相关部门的处罚，如罚款、责令限期改正等。
- 同时，这也可能影响小区的整体品质和业主的居住体验，甚至可能引发业主之间的纠纷和矛盾。
综上所述，小区550多户设计只有100多个车位是否合法，需要结合具体情况进行综合判断。如果您对此有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。