结论：上班迟到、下班早退、中途缺席扣钱是否合法，需根据具体情况判断，主要看公司规章制度是否合法合理以及是否经过民主程序制定并公示。

分析如下：

1. 公司规章制度合法性：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
   • 若公司规章制度中明确规定了迟到、早退、中途缺席的扣钱标准，并且该规章制度已经经过民主程序制定（如职工代表大会讨论、与工会或职工代表协商等）并公示或告知了劳动者，那么该规章制度是合法的，公司可以依据此规章制度对迟到、早退、中途缺席的劳动者进行扣钱处理。

2. 扣钱标准的合理性：

   • 即使公司规章制度合法，扣钱标准也必须合理。如果扣钱标准过高，超出了劳动者因迟到、早退、中途缺席给公司造成的实际损失，那么这种扣钱行为可能被视为违法。例如，劳动者迟到10分钟，公司却扣除了其一天的工资，这种扣钱标准显然是不合理的。

3. 特殊情况下的处理：

   • 如果劳动者迟到、早退、中途缺席是因为不可抗力因素（如自然灾害、交通事故等）导致的，且劳动者能够提供相关证据证明，那么公司不应对其进行扣钱处理。
   • 如果公司未按照法律规定制定或公示规章制度，或者规章制度中的扣钱标准违法或不合理，劳动者有权拒绝公司的扣钱要求，并可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

建议：

• 对于劳动者而言，应仔细阅读并了解公司的规章制度，遵守公司的劳动纪律。如果因特殊情况无法按时到岗或需要提前离岗，应及时与公司沟通并说明情况。
• 对于公司而言，应依法制定和完善劳动规章制度，确保规章制度的合法性和合理性。同时，应加强对劳动者的培训和教育，提高劳动者的法律意识和纪律意识。

可能后果：

• 如果公司违法扣钱，劳动者可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求公司返还被扣的工资，并可能获得相应的赔偿。
• 如果劳动者因迟到、早退、中途缺席给公司造成重大损失，公司可以依据法律规定和规章制度要求劳动者承担赔偿责任，但赔偿金额应合理且与实际损失相符。

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