结论：小区每户只能登记停一辆车进小区月租车位的做法是否合法，需结合具体情况判断，主要包括小区管理规约的约定、业主大会的决议以及相关法律法规的规定。以下从不同角度进行分析：
从小区管理规约和业主大会决议的角度：
- 小区的管理规约是业主共同制定的，用于规范小区内业主行为、维护小区秩序的文件。如果管理规约中明确规定了每户只能登记停一辆车进小区月租车位，且该规约是经过业主大会合法程序通过的，那么这一规定对全体业主具有约束力。
- 业主大会作为小区业主的最高决策机构，其决议对全体业主同样具有约束力。如果业主大会通过了关于每户只能登记停一辆车进小区月租车位的决议，且该决议不违反法律法规的强制性规定，那么这一做法也是合法的。
从相关法律法规的角度：
- 根据《中华人民共和国民法典》中关于业主的建筑物区分所有权的规定，业主对建筑物内的住宅、经营性用房等专有部分享有所有权，对专有部分以外的共有部分享有共有和共同管理的权利。小区内的车位，如果属于共有部分，其使用和管理应当遵循业主共同决定的原则。
- 如果小区的车位属于开发商所有，那么开发商有权制定车位的使用规则。但是，这些规则应当合理，不得侵犯业主的合法权益。如果开发商制定的规则限制了业主的合理停车需求，且没有合理的理由，那么这一规则可能因侵犯业主权益而被认定为无效。
- 另外，还需要考虑当地的地方性法规或规章是否对小区车位的使用有特别规定。如果有，那么应当遵循这些特别规定。
从实际操作和公平性的角度：
- 即使小区管理规约或业主大会决议规定了每户只能登记停一辆车进小区月租车位，这一规定也应当合理且公平。例如，如果小区内车位充足，而规定却过于严格，限制了业主的合理停车需求，那么这一规定可能因缺乏合理性而引发争议。
- 另一方面，如果小区内车位紧张，为了维护小区的整体秩序和公平性，对每户停车数量进行限制可能是必要的。但是，这种限制应当基于合理的考虑，并且应当尽可能平衡各方利益。
建议：
- 如果您对小区每户只能登记停一辆车进小区月租车位的做法有疑问或不满，首先应当查阅小区的管理规约和业主大会的决议，了解这一规定的具体依据和背景。
- 如果您认为这一规定侵犯了您的合法权益或缺乏合理性，您可以尝试与小区物业或业主委员会进行沟通协商，寻求解决方案。
- 如果沟通协商无果，您可以考虑通过法律途径维护自己的权益，例如向相关部门投诉或提起诉讼。
在处理此类问题时，建议您咨询专业律师（即我本人，郭娜律师，专注于刑事辩护、合同纠纷、经济纠纷、取保候审、房产纠纷、法律顾问领域）以获取更具体的法律建议和指导。