结论：事故三年以后保险公司是否还可以代位追偿，需根据具体情况判断，主要取决于诉讼时效是否已过以及相关证据是否充分。

1. 诉讼时效的角度

   • 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。这意味着，从事故发生之日或者保险公司知道或应当知道其有权代位追偿之日起三年内，保险公司应当提起诉讼或采取其他法律措施，否则可能因诉讼时效届满而丧失胜诉权。
   • 特殊情况：如果在这三年期间内，存在诉讼时效中断或中止的情形（如保险公司曾向责任方主张权利、责任方同意履行义务等），则诉讼时效可以重新计算或暂停计算，从而延长保险公司的追偿期限。

2. 证据充分性的角度

   • 即使诉讼时效未过，保险公司要成功代位追偿，还需提供充分的证据证明事故责任方、损失金额以及保险公司已向被保险人支付赔偿金等事实。
   • 时间因素对证据的影响：随着时间的推移，相关证据可能逐渐灭失或变得难以获取（如现场监控视频被覆盖、证人记忆模糊等），这可能增加保险公司代位追偿的难度。

3. 实际操作中的考虑

   • 在实际操作中，保险公司通常会在支付赔偿金后尽快启动代位追偿程序，以避免诉讼时效届满和证据灭失的风险。
   • 建议：如果保险公司因故未能在三年内提起诉讼或采取其他法律措施，但仍有追偿意愿的，建议尽快咨询专业律师，评估诉讼时效是否已过以及证据是否充分，并据此制定合适的追偿策略。

总结与建议：事故三年以后保险公司是否还可以代位追偿，需综合考虑诉讼时效和证据充分性等因素。如果保险公司有代位追偿的意愿，但担心诉讼时效或证据问题，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和解决方案。