结论前置：公司不能仅凭员工在公司工作一年后体检不合格就直接辞退员工，是否可以辞退需根据具体情况判断，包括体检结果与工作岗位的关联性、是否事先告知健康要求、员工是否处于医疗期等因素，并需遵循法定程序。
详细分析
一、公司可以合法辞退的情形
特定疾病与不适合工作：
- 如果员工的体检结果显示其患有特定疾病，且该疾病根据相关法律法规或行业规定，明确禁止从事当前工作（如食品行业从业者患有甲肝等传染性疾病），且该疾病直接影响工作能力或公共安全，公司有权在履行法定程序后辞退员工。但需注意，公司需提供充分证据证明该疾病确实影响工作或公共安全。
- 法律依据：根据《劳动合同法》第四十条，劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的，用人单位可以解除劳动合同。但此条款适用于医疗期满后的情况，且需提前30日书面通知或支付代通知金。
员工隐瞒重大疾病：
- 若员工在入职时故意隐瞒《中华人民共和国传染病防治法》规定的传染病或《中华人民共和国职业病防治法》明确的职业病，且该疾病直接影响工作能力或公共安全，公司有权依据《劳动合同法》第三十九条解除劳动合同。但此情形需公司能证明员工存在故意隐瞒的行为。
二、公司不得随意辞退的情形
体检不合格与工作岗位无必然联系：
- 如果员工的体检不合格项目并非与工作相关的关键健康指标，或者不影响员工正常履行工作职责（如轻度高血压、糖尿病等慢性疾病，且不影响从事办公室工作），公司不能仅仅以体检不合格为由辞退员工。
医疗期内：
- 在医疗期内，员工有权进行治疗和休养，公司不得因此辞退员工。即使员工体检不合格，也需在医疗期满后根据其是否能胜任工作再做决定。
- 法律依据：根据《劳动合同法》及相关规定，医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。医疗期的长度根据员工的工作年限和在本单位的工作年限确定，一般为3-24个月。
未履行法定程序：
- 即使存在合法理由，公司也需遵循法定程序解除劳动合同，如提前通知工会、出具书面解除通知书、说明具体事由及法律依据等。否则可能被认定为违法解除。
三、违法辞退的法律后果
- 如果公司违法辞退体检不合格的员工，员工有权要求公司支付赔偿金。赔偿金的标准通常是经济补偿标准的二倍。
- 经济补偿计算方式：经济补偿按员工在本公司工作的年限计算，每满一年支付一个月工资的标准向员工支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。如果员工月工资高于公司所在地区上年度员工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按员工月平均工资的三倍支付，且支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
总结与建议
- 核查公司制度与合同：员工应确认劳动合同、员工手册中是否明确将体检合格列为录用条件或考核标准。若无相关约定，公司主张缺乏法律依据。
- 要求公司提供证据：员工可要求公司提供体检报告、录用条件公示记录等证据，以证明解除行为的合法性。
- 申请劳动仲裁：若认为被非法辞退，员工可在收到解除通知之日起一年内向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，主张恢复劳动关系或支付赔偿金。
- 协商补偿方案：在仲裁前，员工可与公司协商，争取合理的经济补偿金或其他离职补偿。
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