员工在公司做了事被扣工资是否合法，需分情况讨论：
合法扣薪的情况：
- 规章制度明确且合理：公司必须有经过民主程序制定（如职工代表大会讨论、公示等）且内容合理合法的规章制度，明确规定员工因工作失误给公司造成损失时的扣薪规则。同时，劳动合同中也应包含相关约定，确保员工在入职时就已知晓并同意这些规定。
- 扣除额度合理：因员工故意或重大过失给公司造成直接经济损失的，公司可以要求员工赔偿损失，并从工资中扣除。但扣除的部分不得超过员工当月工资的20%。若扣除后剩余工资低于当地月最低工资标准，则应按最低工资标准支付。
- 遵守最低工资标准：无论何种情况下，扣除工资后的剩余部分都不得低于当地月最低工资标准。这是保障员工基本生活的重要法律原则。
非法扣薪的情况：
- 缺乏明确规定：如果公司没有明确的规章制度或劳动合同约定扣薪规则，或者规章制度未经法定民主程序制定，随意扣工资是不合法的。
- 超出扣除额度：如果公司扣除的工资超过了员工当月工资的20%，或者扣除后导致员工工资低于最低工资标准，这种扣薪行为也是不合法的。
- 损害员工基本生活：即使员工犯错，如果扣薪行为严重影响了员工的基本生活，也可能被视为不合法。例如，员工因轻微失误被扣除大量工资，导致无法维持基本生活，这种扣薪行为就可能受到法律的制裁。
法律建议：
- 与公司沟通协商：如果员工认为公司的扣薪行为不合法，首先应尝试与公司进行沟通，要求说明扣工资的依据，并寻求双方都能接受的解决方案。
- 向劳动监察部门投诉：如果协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉举报公司的违法扣薪行为。劳动监察部门将依法进行调查处理，并保护员工的合法权益。
- 申请劳动仲裁或提起诉讼：在必要时，员工可以申请劳动仲裁或向法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。劳动仲裁或诉讼过程中，员工需要提供相关证据证明公司的扣薪行为不合法，并要求公司承担相应的法律责任。
举例说明：
假设某员工因工作失误给公司造成了1000元的直接经济损失。根据公司的规章制度和劳动合同约定，员工需要承担部分赔偿责任。如果该员工当月工资为5000元，那么公司最多可以从其工资中扣除1000元（即当月工资的20%），扣除后剩余工资为4000元，仍高于当地月最低工资标准。这种情况下，公司的扣薪行为是合法的。但如果公司扣除的工资超过了1000元，或者扣除后导致员工工资低于最低工资标准，那么这种扣薪行为就是不合法的。
总之，员工在公司做了事被扣工资是否合法，取决于公司的规章制度是否明确、扣除额度是否合理以及是否遵守了最低工资标准等法律规定。员工在面对扣薪行为时，应了解自己的权益，并采取适当措施维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。