分公司负责人被抓并不影响分公司的注销流程，但注销过程需遵循法定程序，并确保所有法律义务得到履行。以下是关于分公司注销的详细步骤和注意事项：

一、分公司注销的基本流程

1. 成立清算组：

   • 分公司决定注销后，应首先成立清算组，负责清理分公司的财产、编制资产负债表和财产清单，并通知债权人申报债权。

2. 通知和公告债权人：

   • 清算组应当自成立之日起十日内通知债权人，并于六十日内在报纸上公告。债权人应当自接到通知书之日起三十日内，未接到通知书的自公告之日起四十五日内，向清算组申报其债权。

3. 清理财产和债务：

   • 清算组在清理分公司财产、编制资产负债表和财产清单后，应制定清算方案，并报股东会、股东大会或者人民法院确认。
   • 清算组在清理分公司财产、编制资产负债表和财产清单后，发现分公司财产不足清偿债务的，应当依法向人民法院申请宣告破产。

4. 办理税务注销：

   • 在清算过程中，需向税务机关申报并缴纳所有应纳税款，包括企业所得税、增值税等。
   • 税务机关在确认分公司已缴清所有税款后，会出具税务注销证明。

5. 办理工商注销：

   • 持税务注销证明、清算报告、股东会或董事会决议等文件，向工商行政管理部门申请注销分公司登记。
   • 工商行政管理部门在审核通过后，会收回分公司的营业执照，并出具注销登记证明。

6. 办理银行账户注销：

   • 在完成工商注销后，还需到银行办理分公司银行账户的注销手续。

二、特殊注意事项

1. 分公司负责人的法律责任：

   • 分公司负责人被抓可能涉及刑事或民事责任，但这并不直接影响分公司的注销流程。然而，如果分公司负责人是清算组成员，且因个人原因无法履行清算职责，可能需要更换清算组成员。

2. 分公司财产的独立性：

   • 分公司虽然不具有法人资格，但其财产相对独立于总公司。在注销过程中，应确保分公司的财产得到妥善处理，避免与总公司的财产混淆。

3. 债权债务的妥善处理：

   • 在注销前，必须确保所有债权债务得到妥善处理。如果分公司存在未了结的债务，可能需要总公司承担连带责任。

4. 法律文件的准备和提交：

   • 在注销过程中，需要准备和提交一系列法律文件，如清算报告、股东会或董事会决议、税务注销证明等。这些文件必须真实、准确、完整，否则可能影响注销的顺利进行。

三、建议

1. 寻求专业法律帮助：

   • 分公司注销涉及复杂的法律程序和规定，建议寻求专业律师的帮助，以确保注销过程的合法性和顺利进行。作为专业律师，我可以为你提供详细的法律指导和帮助。

2. 及时沟通与协调：

   • 在注销过程中，与税务机关、工商行政管理部门等相关部门保持及时沟通与协调，确保所有手续得到及时办理和批准。

3. 关注后续事宜：

   • 注销完成后，还需关注后续事宜，如银行账户的注销、员工工资的支付、社保的缴纳等，确保所有法律义务得到履行。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。