加班费以基本工资或最低工资计算，是否合法需分情况讨论，具体如下：
若劳动合同或规章制度明确约定加班费计算基数为基本工资，且基本工资不低于当地最低工资标准，则合法。
- 法律依据：根据《工资支付暂行规定》第十三条，用人单位在劳动者完成劳动定额或规定的工作任务后，根据实际需要安排劳动者在法定标准工作时间以外工作的，应按以下标准支付工资：……（二）休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬；（三）法定休假日安排劳动者工作的，支付不低于工资的百分之三百的工资报酬。这里的“工资”通常理解为劳动合同中约定的工资，若合同明确约定基本工资作为加班费计算基数，且该基本工资不低于最低工资标准，则符合法律规定。
- 实际操作：例如，某员工月基本工资为3000元，当地最低工资标准为2000元，劳动合同约定加班费以基本工资为计算基数。若该员工在休息日加班一天，则加班费为3000元÷21.75天×200%=275.86元（21.75天为月计薪天数），此计算方式合法。
若劳动合同或规章制度未明确约定加班费计算基数，或约定以最低工资为计算基数，则需进一步分析：
- 未约定计算基数时：根据《劳动法》及相关规定，加班费应按照劳动者正常工作时间工资的相应比例支付。若劳动合同未明确约定加班费计算基数，实践中通常以劳动者正常工作时间的工资（包括基本工资、奖金、津贴等）作为计算基数。若仅以基本工资或最低工资为计算基数，可能低于劳动者实际应得的加班费，从而构成违法。
- 约定以最低工资为计算基数时：若劳动合同或规章制度约定加班费以最低工资为计算基数，这一约定可能因违反法律强制性规定（如低于劳动者实际工资水平）而被认定为无效。劳动者有权要求用人单位按照其实际工资水平支付加班费。
特殊情况下的加班费计算：
- 综合计算工时制：对于实行综合计算工时制的劳动者，其加班费计算需遵循特定规则。在综合计算周期内，若劳动者总实际工作时间超过总法定标准工作时间，超出部分应视为延长工作时间，并按不低于工资的150%支付加班费。此时，加班费的计算基数同样应遵循上述原则。
- 不定时工作制：对于实行不定时工作制的劳动者，通常不适用加班费的规定。但若劳动者在法定节假日工作，用人单位仍需支付不低于工资的300%的加班费。
建议与提醒：
- 劳动者在签订劳动合同时，应仔细阅读合同条款，特别是关于加班费计算基数的约定。若合同未明确约定或约定不明，可要求用人单位明确说明或补充约定。
- 若劳动者发现用人单位以基本工资或最低工资为计算基数支付加班费，且该基数低于其实际工资水平，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自身合法权益。
- 用人单位在制定规章制度或签订劳动合同时，应遵循法律法规的规定，合理确定加班费计算基数，避免因违法而承担法律责任。
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