甲方一般不可以随意将建筑工程的人防工程设计分开，但具体需视情况而定。以下从不同角度进行分析：

一、从合同约定角度

如果甲方与乙方（设计单位或施工单位）在合同中明确约定了人防工程设计的整体性要求，或者明确禁止将人防工程设计分开，那么甲方应当遵守合同约定，不得随意将人防工程设计分开。因为合同是双方意思表示一致的产物，具有法律约束力，双方都应当按照合同约定履行自己的义务。

二、从法律法规角度

1. 人防工程设计的特殊性：人防工程是战时保护人民生命和财产安全的重要设施，其设计需要遵循特定的规范和标准。如果甲方随意将人防工程设计分开，可能会影响人防工程的整体性和防护效能，从而违反相关法律法规的规定。
2. 相关法律法规要求：根据《中华人民共和国人民防空法》等相关法律法规，人防工程的设计、施工、验收等环节都需要严格遵守国家规定的标准和规范。如果甲方将人防工程设计分开，可能会导致设计不符合规范，进而影响人防工程的合法性和安全性。

三、从实际操作角度

1. 设计连贯性：人防工程设计需要考虑到战时的各种因素，如防护等级、人员疏散、物资储备等。这些因素之间相互关联，需要设计单位进行整体规划和设计。如果甲方将人防工程设计分开，可能会导致设计之间的衔接不畅，影响人防工程的整体效果。
2. 施工难度和成本：将人防工程设计分开可能会增加施工的难度和成本。因为不同的设计单位或施工单位之间可能存在沟通不畅、协调困难等问题，导致施工进度延误、成本增加等后果。

四、特殊情况下的处理

如果甲方确实有需要将人防工程设计分开的合理理由，如设计单位无法承担全部设计任务、设计任务需要分阶段进行等，那么甲方应当与乙方进行充分协商，并在合同中明确约定分开的具体方式、责任划分等事项。同时，甲方还需要确保分开后的设计仍然符合相关法律法规和规范的要求，不影响人防工程的整体性和防护效能。

建议：在实际操作中，甲方应当谨慎对待人防工程设计的分开问题。如果确实有需要分开的合理理由，应当与乙方进行充分协商，并在合同中明确约定相关事项。同时，甲方还需要加强对分开后设计的监督和管理，确保设计符合相关法律法规和规范的要求。如果您在建筑工程领域遇到任何法律问题，都可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律意见。