公司是否有义务配合银行扣负债人的工资，需分情况讨论：
若负债人与银行之间存在有效的债权债务关系，且银行已通过法律程序获得执行依据（如生效判决、裁定等）：
- 在这种情况下，银行有权向法院申请强制执行负债人的财产，包括工资收入。
- 公司作为负债人的工资发放单位，有义务配合法院的执行工作，按照法院的要求协助扣划负债人的工资。这是基于法院的强制执行权，公司必须履行相应的协助义务，否则可能面临法律责任。
若银行未通过法律程序获得执行依据，仅凭与负债人之间的债权债务关系要求公司扣划工资：
- 在这种情况下，公司没有义务直接配合银行扣划负债人的工资。因为工资是劳动者的劳动报酬，受到法律保护，非经法定程序不得随意扣划。
- 银行若想通过扣划工资的方式实现债权，必须先通过法律程序获得执行依据，如起诉负债人并获得生效判决，然后向法院申请强制执行。
法律背景与建议：
- 法律背景：根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释的规定，法院有权对被执行人的财产进行查封、扣押、冻结等强制执行措施。工资作为被执行人的财产之一，在符合法定条件的情况下，可以被法院强制执行。
- 建议：对于公司而言，在面对银行要求扣划负债人工资的情况时，应首先核实银行是否已获得法院的执行依据。若银行未获得执行依据，公司有权拒绝配合；若银行已获得执行依据，公司则应按照法院的要求履行协助义务，以免面临法律责任。同时，公司也可以建议负债人积极与银行协商解决债务问题，避免法律纠纷的发生。
可能的法律后果：
- 若公司未按照法院的要求协助扣划负债人的工资，可能面临法院的罚款、拘留等强制措施，甚至可能被追究刑事责任（在情节严重的情况下）。
- 若公司错误地扣划了负债人的工资（如银行未获得执行依据而公司擅自扣划），则可能构成对负债人财产权的侵害，需要承担相应的民事赔偿责任。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。