劳动合同赔偿金一般是按照应发工资来计算的。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据与原则
《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条：该条款明确规定了经济补偿的计算方式，即按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。这里的“月工资”指的是劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资，且根据《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条的进一步阐释，该“月工资”应按照劳动者应得工资计算，即应发工资。
应发工资的定义：应发工资是劳动者在正常提供劳动的情况下应得的全部劳动报酬，包括基本工资、奖金、津贴、补贴等货币性收入。它全面反映了劳动者的劳动报酬情况，是计算经济补偿金等赔偿金的合理基数。
二、应发工资与实发工资的区别
应发工资：是劳动者在提供正常劳动情况下，用人单位应当支付给劳动者的全部劳动报酬，它包含了劳动者应得的各项收入，是计算赔偿金的合理基数。
实发工资：是劳动者实际到手的收入，即应发工资扣除个人所得税、社保公积金个人部分等费用后的数额。由于这些扣除项并非基于劳动者的劳动付出或工作表现，因此在计算赔偿金时通常不予考虑。
三、具体应用场景分析
经济补偿金计算：在劳动合同解除或终止时，用人单位需按照劳动者在本单位工作的年限和月工资标准支付经济补偿金。这里的月工资标准应按照应发工资计算，以确保劳动者得到合理的经济补偿。
其他赔偿金计算：在涉及劳动合同纠纷的其他赔偿金计算中，如二倍工资差额、工伤赔偿中的停工留薪期工资等，也通常按照应发工资作为计算基数。
四、特殊情况说明
虽然一般情况下赔偿金是按照应发工资计算的，但在某些特定情况下，如人身损害赔偿中的误工费计算，则可能按照实发工资来计算。这是因为误工费的本质是补偿受害人因受伤无法工作而导致的实际收入损失，因此应以实发工资为基数进行计算。然而，在劳动合同纠纷中，这种情况较为少见。
五、总结与建议
综上所述，劳动合同赔偿金一般是按照应发工资来计算的。这一规定旨在全面反映劳动者的劳动报酬情况，保障其在解除或终止劳动合同时能获得合理补偿。因此，在处理劳动合同纠纷时，用人单位和劳动者都应明确这一点，并据此进行赔偿金的计算和支付。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供更详细、更专业的法律建议。