结论：盗窃花卉后即使已经调解赔偿店家，派出所仍有可能追究刑事责任，但具体是否追究需结合案件实际情况判断。以下从不同角度详细分析：

1. 刑事责任与民事赔偿的关系

• 刑事责任：盗窃行为属于违反《刑法》的犯罪行为，其核心是侵犯公私财产所有权。根据《刑法》第二百六十四条，盗窃公私财物，数额较大或多次盗窃、入户盗窃、携带凶器盗窃、扒窃的，构成盗窃罪，需承担刑事责任。
• 民事赔偿：调解赔偿是犯罪嫌疑人与被害人之间的民事和解，仅解决财产损失的赔偿问题，不免除刑事责任。即使赔偿完毕，公安机关仍可依法追究刑事责任，但赔偿情节可能作为量刑时的从轻情节。

2. 派出所是否追究的考量因素

• 案件性质：若盗窃花卉价值较低（未达当地“数额较大”标准，如一般地区为2000元以上），可能不构成犯罪，仅属治安违法，按《治安管理处罚法》第四十九条处罚（拘留+罚款）。此时赔偿后，派出所可能不再追究刑事责任，但可能给予行政处罚。
• 犯罪情节：若盗窃花卉价值较高或存在多次盗窃、入户盗窃等情节，构成犯罪，派出所通常需立案侦查并移送检察院审查起诉。赔偿仅影响量刑，不改变案件性质。
• 被害人态度：被害人出具谅解书可能对量刑有帮助，但公安机关的立案侦查是法定职责，不受被害人意志完全左右。

3. 可能的结果

• 不追究刑事责任：若案件不构成犯罪（如价值低、初犯、赔偿及时），派出所可能作出不予立案决定，或撤销案件。
• 追究刑事责任：若构成犯罪，即使赔偿，案件仍会进入刑事程序，但嫌疑人可能因赔偿获得从轻处罚（如缓刑、较轻罚金）。

4. 建议

• 主动配合调查：若已被派出所传唤，应如实陈述事实，积极配合调查，避免逃避或抗拒。
• 争取从轻情节：赔偿、认罪认罚、初犯等情节均可作为从轻依据，建议通过律师向办案机关提交相关材料。
• 咨询专业律师：案件处理需结合具体证据和当地司法实践，建议直接向我咨询，以便更精准分析案件走向。

示例：若张三盗窃一盆价值500元的花卉，赔偿后派出所可能因其价值低、初犯，作出治安处罚（如拘留5日）而非刑事立案；但若李四盗窃多盆花卉价值5000元，即使赔偿，仍可能因构成盗窃罪被追究刑事责任，但量刑时可能从轻。

如有进一步疑问或需具体分析，可直接向我咨询。