结论：通常情况下，重疾险在购买一年内做了开颅手术未理赔，六年后一般不能再就该次手术申请理赔，但存在一些特殊情况可能支持理赔，以下为你详细分析：
- 保险合同中关于等待期和理赔时效的约定
- 等待期条款：重疾险一般设有等待期，通常为90天或180天，在等待期内因非意外原因患合同约定的重大疾病，保险公司一般不承担给付保险金的责任。如果购买重疾险后一年内做了开颅手术，此时早已过了等待期，但若该手术对应的疾病在合同约定的保障范围内，从合同条款本身看，只要符合其他理赔条件，保险公司应予以理赔。然而，当时保险公司拒绝理赔，可能存在对疾病是否符合合同定义、手术是否必要等认定上的分歧，或者存在投保时未如实告知等影响理赔的情况。
- 理赔时效条款：保险合同中一般会规定理赔申请的时效，被保险人或受益人应在知道保险事故发生之日起一定期限内（如2年）提出理赔申请。如果超过这个时效，保险公司可能不再受理理赔申请。从你描述的情况看，已经过去六年，从常规的理赔时效角度，可能超过了合同约定的申请期限。
- 特殊情况分析
- 保险公司存在过错：如果当时保险公司拒绝理赔存在过错，例如错误认定疾病不属于保障范围、未尽到合理的调查和说明义务等。在这种情况下，你可以收集相关证据，如保险合同、病历资料、与保险公司的沟通记录等，向保险公司提出重新审核理赔申请的要求，或者通过法律途径维护自己的权益。但需要证明保险公司的过错与拒绝理赔之间存在因果关系，这可能需要专业的法律分析和证据支持。
- 不可抗力或其他正当理由导致未及时申请理赔：如果在六年的时间里，存在不可抗力（如自然灾害、战争等）或其他正当理由（如被保险人因重大疾病导致意识不清、无法行使权利等），导致未能及时提出理赔申请。在这种情况下，你可以向保险公司说明情况，并提供相关证明材料，争取保险公司的理解和支持，看是否能够特殊处理理赔申请。不过，这种情况的认定比较严格，需要充分的证据支持。
- 合同条款存在歧义或违法违规：如果保险合同中的相关条款存在歧义，或者违反了法律法规的强制性规定，导致对理赔条件和时效的约定不明确或不合法。在这种情况下，法院可能会倾向于保护被保险人的利益，对合同条款作出有利于被保险人的解释，从而支持你的理赔申请。但这需要专业的法律人士对合同条款进行详细分析和论证。