当两个法人（即两个公司或企业）之间签订合同并需要开具发票时，通常的流程取决于双方是否都已办理税务登记以及具体的业务需求。以下是一个清晰、详细且深入的解答：
一、基本前提
税务登记：首先，确保双方公司都已按照国家税收法规办理了税务登记，这是开具发票的基本前提。
合同内容：合同中应明确约定交易的内容、金额、付款方式以及发票的开具要求等关键信息。
二、发票开具流程
1. 自行开具发票（如果双方都有领用发票的资格）
- 领用发票：双方公司应按照税务机关的规定，领用与其经营业务范围相应的发票。
- 开具发票：在交易完成后，根据合同约定的金额和内容，由销售方（即提供商品或服务的一方）自行开具发票给购买方。
- 发票内容：发票上应准确填写购买方和销售方的名称、纳税人识别号、地址、电话、开户行及账号等信息，以及商品或服务的名称、规格、数量、单价和金额等。
2. 申请代开发票（如果一方或双方没有领用发票的资格，或需要临时开具超出领用范围的发票）
申请条件：
- 纳税人虽已领用发票，但临时取得超出领用发票使用范围或者超过领用发票开具限额以外的业务收入，需要开具发票的。
- 被税务机关依法收缴发票或者停止发售发票的纳税人，取得经营收入需要开具发票的。
- 依法不需要办理税务登记的单位和个人，临时取得收入，需要开具发票的（这种情况较少见于法人之间）。
- 其他符合税务机关规定代开条件的情形。
申请流程：
- 准备材料：包括代开增值税发票缴纳税款申报单、营业执照（如非必要则不需提供，但通常建议携带以备查验）、经办人身份证件、相关业务合同或协议等。
- 提交申请：将准备好的材料提交至主管税务机关的办税服务厅或通过网上税务局进行申请。
- 审核与缴税：税务机关对提交的材料进行审核，审核通过后，纳税人需缴纳相应的税款。
- 开具发票：税务机关代开发票并加盖代开发票专用章，然后将发票发放给纳税人。
注意事项：
- 代开发票时，税务机关会先征收税款，再开具发票。
- 确保合同内容与发票内容一致，避免出现税务风险。
三、特殊情况处理
- 跨区域经营：如果一方是外省（自治区、直辖市）的纳税人，来本辖区临时从事经营活动，原则上应办理跨区域涉税事项报验登记并领取发票自行开具。如果业务量小、开票频度低，可以申请经营地税务机关代开。
- 差额征税：如果交易适用差额征税办法缴纳增值税，且不得全额开具增值税专用发票的，应按照相关规定处理，并在发票上注明差额征税的相关信息。
四、建议与提醒
- 提前规划：在签订合同前，双方应就发票的开具要求进行充分沟通，并明确在合同中。
- 合规操作：确保发票的开具符合税收法规的要求，避免出现虚开发票等违法行为。
- 及时沟通：如果在发票开具过程中遇到问题或疑问，应及时与税务机关或专业税务顾问进行沟通。
希望以上解答能够帮助您更好地理解法人与法人之间签合同后发票的开具流程。如果您还有其他疑问或需要进一步的帮助，请随时咨询。