针对您提出的“业主窗改门由谁处理以及怎么处罚”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
一、处理主体
业主擅自将窗户改为门的行为，通常由城市管理部门（如城管局）负责处理。这是因为该行为往往涉及到城市容貌、建筑安全以及规划管理等方面，而城市管理部门正是负责这些方面的监管和执法工作。
二、法律依据
《住宅室内装饰装修管理办法》：该办法明确规定，改变住宅外立面或在非承重外墙上开门窗需经城市规划行政主管部门批准。未经批准擅自进行此类行为的，将受到相应的行政处罚。
地方性法规：各地根据实际情况，可能还制定了更为详细的地方性法规或条例，对“窗改门”等行为进行进一步规范和处罚。例如，《青岛市建筑外立面管理办法》就明确规定了不得擅自改变建筑外立面造型、材料和色彩，以及不得擅自改变原有门、窗位置、尺寸、造型等。
三、处罚措施
对于擅自“窗改门”的行为，城市管理部门通常会采取以下处罚措施：
责令限期改正：要求业主按房屋原规划图将门窗恢复原状，以消除对城市容貌和建筑安全的影响。
罚款：如果业主拒不整改或整改不到位，城市管理部门将依法对其进行罚款。罚款的金额根据违法行为的严重程度、影响范围以及地方性法规的具体规定而定。例如，若涉及建筑主体和承重结构变动而没有设计方案擅自施工的，根据《建设工程质量管理条例》，可处5万元以上10万元以下的罚款。
其他处罚：在极端情况下，如果“窗改门”行为严重违反了城市规划或建筑安全规定，且拒不整改，城市管理部门还可能采取强制拆除等更为严厉的处罚措施。
四、建议与思考
厘清法律边界：建议进一步细化建筑外立面管理的技术标准和操作规范，明确允许改造的范围、条件和程序，为业主提供明确指引，也为审批部门提供审核标准和技术要求。
完善审批流程：对于确有合理需求的业主，提供明确的审批指引和通道，经专业部门审查同意后，允许其依法进行改造，以解决业主的切实需求。
加强沟通与协商：在处理“窗改门”问题时，城市管理部门应加强与业主的沟通与协商，了解其实际需求和困难，尽量在法律框架内寻求合理的解决方案。
加强源头管控：严格业主装修阶段的审查与监督，确保建筑外立面改动符合规定。这应由城市管理部门和街道社区共同监管、监督，以防止类似问题的再次发生。
综上所述，业主擅自“窗改门”的行为将由城市管理部门负责处理，并依据相关法律法规进行处罚。为了有效解决这一问题，建议从厘清法律边界、完善审批流程、加强沟通与协商以及加强源头管控等方面入手，以实现城市管理与民生需求的平衡。