结论：自离和旷工是两个相关但不同的概念，公司是否故意将自离算作旷工并据此作出处理，取决于公司的规章制度、劳动合同以及相关法律法规的具体规定。若公司规章制度或劳动合同中无明确规定，且处理方式缺乏合法依据，则公司此举可能违法。
分析说明：
定义与区别：
- 旷工：指员工在正常工作日内，未事先请假或请假未获批准的情况下，无故缺勤的行为。这是一种明确的违反劳动纪律的行为。
- 自离：通常指员工未经用人单位同意，擅自离职、不再继续履行劳动合同的行为。自离往往意味着员工没有遵循正常的离职流程，如提前通知用人单位、办理工作交接等。
自离与旷工的关联：
- 在某些情况下，自离过程中可能包含旷工行为。例如，员工在未办理离职手续且未获得单位许可的期间不去上班，这部分时间一般会被认定为旷工。
- 但并非所有自离都会被视为旷工。是否将自离视为旷工并据此处理，需依据公司规章制度、劳动合同及法律法规。如果公司规章制度或劳动合同明确规定自离属于旷工，并有相应处罚措施，则自离可被视为旷工并按旷工规定处理。
用人单位的处理权限与义务：
- 用人单位有权根据自身合法制定的规章制度对旷工行为作出处理，如扣除旷工期间工资、给予纪律处分等。但规章制度必须经过民主程序制定、内容不违反法律法规强制性规定且已向劳动者公示。
- 即使员工存在自离和旷工情况，用人单位也不能随意克扣员工已正常出勤期间应得的工资。
- 在处理自离员工时，用人单位应查阅公司规章制度、劳动合同及相关法律法规，并根据具体情况作出决定。避免因处理不当而引发法律纠纷和经济损失。
法律建议：
对于员工：
- 在离职前应与公司进行协商和沟通，按照正常离职流程办理手续，以避免不必要的法律纠纷和经济损失。
- 如果公司故意将自离算作旷工并据此作出不合理的处理，员工可以收集相关证据，如工作记录、请假记录、公司规章制度等，向劳动仲裁机构申请仲裁或向法院提起诉讼。
对于用人单位：
- 应完善规章制度，明确自离和旷工的定义及处理方式，并确保规章制度的合法性和有效性。同时，加强对员工的劳动纪律教育和管理，维护正常的生产经营秩序。
- 在处理自离员工时，应确保处理方式有合法依据，避免因处理不当而引发法律纠纷和经济损失。
可能后果：
- 如果公司故意将自离算作旷工并据此作出不合理的处理，如扣除员工工资、给予不合理的纪律处分等，员工有权向劳动仲裁机构申请仲裁或向法院提起诉讼，要求公司承担相应的法律责任。
- 如果公司的处理方式缺乏合法依据，且给员工造成了经济损失，公司可能需要承担赔偿责任。
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