核心结论：职务侵占立案后会计举报公司违法行为，公司可从法律程序应对、内部管理调整、与举报人沟通协调三个角度处理，具体如下：

1. 法律程序应对

   • 针对职务侵占案件：既然已经立案，公司应积极配合公安机关的调查工作，提供与职务侵占相关的证据材料，如财务账目、交易记录、相关人员的陈述等，以协助公安机关查明事实，追究侵占人的法律责任。这不仅能维护公司的合法权益，也有助于厘清公司内部可能存在的管理漏洞。
   • 针对会计举报的违法行为：公司首先要对会计举报的内容进行全面、深入的调查核实。如果举报内容属实，公司要认识到自身行为的违法性，主动配合相关监管部门（如税务、工商等）的调查，按照法律要求进行整改，该补缴税款的补缴税款，该纠正违规经营行为的及时纠正。若举报内容不实，公司要收集相关证据证明自身行为的合法性，必要时可以通过法律途径维护公司的名誉权，如起诉会计侵犯名誉权等。

2. 内部管理调整

   • 完善财务制度：以此次事件为契机，对公司的财务制度进行全面审查和完善。加强财务审批流程，明确各个环节的职责和权限，确保每一笔资金的使用都有合理的依据和严格的监督。例如，对于大额资金的支出，要实行多人审批制度，避免个人独断专行。
   • 加强内部审计：建立健全内部审计机制，定期对公司的财务状况、经营活动等进行审计。及时发现和纠正可能存在的问题，防止类似职务侵占和违法行为再次发生。内部审计人员要保持独立性和客观性，对发现的问题要如实报告并提出整改建议。
   • 开展员工法律培训：组织全体员工进行法律知识培训，特别是与公司经营相关的法律法规，如刑法中关于职务侵占、商业贿赂等罪名的规定，以及税法、公司法等相关法律。提高员工的法律意识和合规意识，让员工明白违法行为的后果，从源头上减少违法行为的发生。

3. 与举报人沟通协调

   • 了解举报动机：在不影响调查的前提下，尝试与会计进行沟通，了解其举报的动机和目的。如果是出于对公司发展的关心，希望通过举报促使公司改正违法行为，公司可以与会计坦诚交流，说明公司整改的决心和措施，争取其理解和支持。
   • 保护举报人权益：如果会计的举报行为是合法合规的，公司要按照相关法律法规的规定，保护举报人的合法权益，不得对其进行打击报复。否则，公司可能会面临更严重的法律后果，如被追究行政责任甚至刑事责任。
   • 协商解决纠纷：如果会计的举报给公司带来了一定的负面影响，公司可以在合法合规的前提下，与会计协商解决纠纷。例如，通过签订和解协议，明确双方的权利义务，消除不良影响。

后续建议：在整个处理过程中，公司要密切关注法律程序的发展和内部管理的调整效果，及时总结经验教训。如果遇到复杂的法律问题或不确定的情况，要及时向我咨询，我会根据具体情况为你提供详细的法律建议和解决方案。