结论：违建房屋能否办理合法手续，需根据具体情况判断。部分违建房屋在符合一定条件且经过补救措施后，有可能实现合法化；但严重违反城乡规划的违建房屋，则通常无法补办手续，将面临拆除等处罚。
一、可以补办手续的情况及流程
确认违建性质与可补救性
- 首先，需要明确违建房屋的具体性质，包括是否违反了城乡规划、土地管理等相关法律法规。
- 评估违建房屋的可补救性，即是否有可能通过补办手续使其合法化。这通常取决于违建房屋对城乡规划的影响程度、是否存在安全隐患等因素。
采取补救措施
- 如果违建房屋符合一定的补救条件，如不影响城市规划、不存在安全隐患等，可以尝试采取补救措施。
- 补救措施可能包括整改违建部分、缴纳罚款、补办相关建设手续等。具体措施需根据当地政策和实际情况而定。
补办手续流程
- 用地手续：向国土资源管理部门提出用地申请，提交土地使用证明文件等相关材料，接受审核并获得用地批准文件。
- 规划手续：将建设项目规划设计方案等材料提交给城乡规划部门，接受设计方案审查。方案通过后，核发建设工程规划许可证。
- 施工许可手续：向建设行政主管部门提交建设工程规划许可证、施工图纸及技术资料等材料，接受审查与现场勘察。审查合格后，颁发建筑工程施工许可证。
二、无法补办手续的情况
若违建房屋严重违反城乡规划，如占用基本农田、消防通道、公共绿地，或对周边居民的通风、采光等造成严重影响，且无法采取改正措施消除对规划实施的影响，则通常无法通过补办手续使其合法化。此类违建房屋可能面临以下处罚：
- 限期拆除：政府相关部门会依法要求违建房屋的所有人或使用人在规定期限内自行拆除违建部分。
- 没收实物或违法收入：在某些特殊情况下，如违建房屋属于非法占用国有土地或集体土地建设的，政府可能会依法没收该建筑物或违法收入。
三、特殊情况的考量
在某些特定历史时期或特殊情况下建造的违建房屋，如果未造成严重安全隐患或社会影响，可能会考虑给予一定的宽限或补偿措施。然而，这并不意味着可以为这些违建房屋办理合法手续，而是基于特殊情况下的个别处理。因此，在处理违建房屋时，仍需严格遵守相关法律法规和政策规定。
四、法律建议
- 及时咨询：在处理违建房屋问题时，建议及时咨询当地相关部门或专业律师，了解具体的政策和操作流程。
- 遵守规定：在建造房屋或其他建筑物前，务必先咨询当地相关部门，了解具体的规划和建设要求，并按照规定的程序进行申请和审批。遵守相关法律法规和政策规定，是确保建筑合法性的关键。
- 保持耐心：由于违建房屋的处理过程可能较为复杂且耗时较长，因此需要保持足够的耐心和细心，积极配合相关部门的工作。
如有任何关于违建房屋处理的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。