当建设单位在未完工的情况下未及时支付工程款时，作为承包人，您可以通过以下步骤来起诉并主张工程款，以维护自身的合法权益：
一、初步沟通与证据收集
友好沟通：
- 首先，尝试与建设单位进行友好且细致的沟通，明确欠款的具体金额、未支付的原因以及还款的期限等关键信息。
- 沟通时，保持冷静和理性，力求通过协商达成和解，避免矛盾升级。
发送催告信函：
- 若协商无果，应立即向建设单位发送正式的催告信函，明确要求其尽快支付拖欠的工程款及相应的赔偿金。
- 保留好信函的发送记录，作为后续法律程序的证据之一。
全面收集证据：
- 搜集所有与工程款支付相关的证据材料，包括但不限于工程承包合同、补充协议、施工日志、工程进度报告、质量检验报告、变更指令、往来函件、付款凭证等。
- 这些证据将用于证明欠款事实、损失情况以及您的索赔依据。
二、正式索赔程序
确定索赔金额：
- 根据合同条款和实际完成的工程量，计算合同内未支付的工程款。
- 考虑因建设单位原因导致的额外费用，如额外工作费用、工期延误损失、资金占用损失等，并提供详细的计算依据。
发出索赔通知：
- 按照合同约定的方式和时间（通常为知道或应当知道索赔事件发生后的一定期限内，如28天），向建设单位发出书面索赔通知。
- 索赔通知应明确指出索赔事件、理由、依据以及初步提出的索赔金额和工期索赔要求（如适用）。
提交索赔报告：
- 在发出索赔通知后的规定时间内（通常也是28天），向建设单位提交详细的索赔报告。
- 索赔报告应包括标题、编号、双方信息、索赔事件概述、索赔依据、索赔金额计算明细、工期索赔（如适用）以及结语等内容，确保报告内容完整、准确、有说服力。
三、法律途径与救济措施
调解：
- 若协商不成，可考虑引入第三方调解机构进行调解，以寻求高效、灵活的解决方案。
- 调解过程中，保持开放和合作的态度，积极寻求双方都能接受的解决方案。
仲裁或诉讼：
- 若调解无果，且合同中有仲裁条款或双方同意仲裁，则可根据合同约定选择仲裁机构进行仲裁。
- 若合同未约定仲裁或双方不同意仲裁，则可向工程所在地法院或被告所在地法院提起诉讼。
- 准备充分的诉讼材料，包括诉讼状、证据材料等，并积极参与庭审过程，充分阐述您的索赔理由和依据。
申请财产保全：
- 在起诉的同时，可向法院申请财产保全，以防止建设单位在诉讼期间转移或隐匿财产，保障您的诉求在执行阶段顺利实现。
申请强制执行：
- 若法院判决胜诉后建设单位仍不履行支付义务，可向法院申请强制执行，通过法律手段强制其履行支付义务。
行使优先受偿权：
- 根据《中华人民共和国民法典》第八百零七条的规定，您作为承包人，在发包人未按照约定支付价款时，有权催告发包人在合理期限内支付价款。
- 若发包人逾期不支付，且建设工程性质适宜折价或拍卖，您可与发包人协议将工程折价，或请求人民法院将工程依法拍卖，并就拍卖价款优先受偿。
四、注意事项
- 在整个索赔过程中，保持冷静和理性，避免情绪化行为影响索赔效果。
- 确保您的诉求合理合法，遵循法律法规和合同约定。
- 妥善保管所有与索赔相关的证据材料，以备不时之需。
- 遵循法定程序和时限要求，确保索赔程序的合法性和有效性。
综上所述，面对建设单位未及时支付工程款的问题，您应综合运用协商、调解、仲裁、诉讼等多种手段进行索赔，并严格遵循法律法规和合同约定，以确保自身合法权益得到有效维护。