施工单位自建监理机构一般是不合法的。以下从不同角度对此问题进行分析：
法律法规角度：
- 根据《中华人民共和国建筑法》及相关规定，建设工程监理应当由具有相应资质的监理单位承担。监理单位与施工单位应当是独立的两个主体，以确保监理的公正性和客观性。
- 如果施工单位自建监理机构，那么该机构在形式上和实质上都难以保持与施工单位的独立性，从而可能影响监理的公正性和有效性。这种自建监理机构的行为，很可能违反了相关法律法规中关于监理单位独立性和资质要求的规定。
行业规范角度：
- 建设工程监理行业有一套严格的规范和标准，包括监理单位的资质管理、监理人员的资格要求、监理工作的程序和方法等。这些规范和标准旨在确保监理工作的专业性和有效性。
- 施工单位自建监理机构，可能无法满足这些行业规范和标准的要求，从而影响监理工作的质量。例如，自建监理机构可能缺乏必要的专业设备和检测手段，或者监理人员不具备相应的专业知识和经验。
实际操作角度：
- 在实际操作中，如果施工单位自建监理机构，那么该机构在监理过程中可能会受到施工单位的干扰和影响，从而难以保持客观公正的态度。这可能导致监理工作流于形式，无法真正发挥监理的作用。
- 此外，自建监理机构还可能引发其他一系列问题，如监理费用不透明、监理责任不明确等。这些问题都可能对建设工程的顺利进行产生不利影响。
法律建议：
- 施工单位应当严格遵守相关法律法规和行业规范，不要自建监理机构。如果需要监理服务，应当选择具有相应资质和信誉的监理单位进行合作。
- 如果施工单位已经自建了监理机构，并且该机构已经在实际工作中发挥了监理作用，那么建议施工单位尽快对该机构进行整改，确保其符合相关法律法规和行业规范的要求。同时，施工单位也可以考虑与外部监理单位进行合作，以引入更专业、更独立的监理服务。
可能的法律后果：
- 如果施工单位自建监理机构的行为被相关部门发现并认定为违法，那么施工单位可能会面临行政处罚、罚款等法律后果。
- 此外，如果自建监理机构的行为导致了建设工程的质量问题或安全事故，那么施工单位还可能承担相应的民事责任和刑事责任。
综上所述，施工单位自建监理机构一般是不合法的，并且可能带来一系列严重的法律后果。因此，建议施工单位严格遵守相关法律法规和行业规范，不要自建监理机构。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。