结论：对方在股权转让签字后索要50万是否合法，需结合双方协议、交易背景、索要理由综合判断，若对方行为涉嫌违法（如敲诈勒索、合同诈骗），可直接向公安机关经侦部门或辖区派出所报案；若属于合同纠纷，需通过协商、诉讼或仲裁解决。以下分情况说明：
一、对方索要50万是否合法？需分情况判断
若双方协议中明确约定了“额外费用”条款
需核查股权转让协议、补充协议等书面文件，若协议中明确约定了“签字后需支付50万作为XX费用”（如违约金、补偿金、服务费等），且该条款不违反法律强制性规定（如无显失公平、欺诈、胁迫等情形），则对方索要行为可能合法，但您有权要求对方说明费用性质、计算依据，并可协商调整金额。
若协议中无约定，对方以“行业惯例”“关系费”等理由索要
若双方未在协议中约定该费用，且对方无法提供合法依据（如您存在违约行为需支付违约金、对方实际提供了额外服务等），则对方行为可能涉嫌违法：
- 若以威胁、恐吓、限制人身自由等方式索要：可能构成《刑法》第274条规定的敲诈勒索罪（数额较大或多次敲诈的，处三年以下有期徒刑；数额巨大或有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑）。
- 若以虚构事实、隐瞒真相的方式索要：可能构成《刑法》第266条规定的合同诈骗罪（若以签订、履行合同为名骗取财物，数额较大的，处三年以下有期徒刑；数额巨大或有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑）。
- 若仅口头索要，无威胁或欺诈行为：可能属于民事纠纷中的“不当得利”，您有权拒绝支付，并通过诉讼要求对方返还已支付的款项（如有）。
二、如何报警？需根据性质选择报案部门
若涉嫌刑事犯罪（敲诈勒索、合同诈骗）
- 报案材料：股权转让协议、对方索要款项的聊天记录、录音、转账记录、证人证言等证据。
- 报案流程：
（1）携带材料到对方所在地或行为发生地的公安机关经侦部门（经济犯罪侦查支队/大队）或辖区派出所报案；
（2）填写《报案材料》，详细说明事件经过、对方信息、索要金额及理由；
（3）公安机关受理后会立案侦查，若认定构成犯罪，会依法追究对方刑事责任。
若属于民事纠纷（无犯罪嫌疑）
公安机关一般不会直接处理，您需通过以下途径解决：
- 协商：与对方沟通，要求其提供合法依据或调整金额；
- 诉讼：向法院起诉，要求确认对方索要行为无效或返还已支付款项；
- 仲裁：若协议中有仲裁条款，可向约定的仲裁机构申请仲裁。
三、关键建议
- 立即固定证据：保存所有与股权转让、对方索要款项相关的书面文件、电子数据（如微信、邮件）、录音录像等，避免对方销毁证据。
- 谨慎支付款项：在未明确对方索要合法性前，切勿随意支付，否则可能被认定为“自愿履行”，后续维权困难。
- 咨询专业律师：股权转让涉及公司法、合同法、刑法等多领域法律问题，建议委托律师协助分析协议条款、评估风险，并制定应对方案。
我是王律师，擅长处理股权纠纷、合同诈骗等经济类案件，若您有相关证据或需进一步分析，可直接向我咨询，我会为您详细解答。