结论：客户报警店铺但老板不在，登记员工信息这一行为本身并不直接构成违法，但具体是否违法需结合登记的目的、方式以及后续处理情况等因素综合判断。以下从不同角度进行分析：

1. 登记员工信息的合法性基础：

   • 在一般情况下，警方为了调查案件或处理警情，有权要求相关人员提供必要的信息，包括员工信息。这是警方履行职责的一部分，旨在维护社会治安和公共安全。
   • 如果警方在登记员工信息时，遵循了合法程序，如出示了相关证件、说明了登记目的等，且登记的信息仅用于案件调查或警情处理，那么这一行为通常是合法的。

2. 可能存在的违法情形：

   • 非法目的：如果警方登记员工信息并非出于案件调查或警情处理的需要，而是出于其他非法目的，如泄露给第三方用于商业用途或侵犯个人隐私等，那么这一行为就可能构成违法。
   • 非法方式：如果警方在登记员工信息时，未遵循合法程序，如未出示证件、未说明登记目的、强行要求提供信息等，或者登记的信息超出了必要范围，那么这一行为也可能构成违法。
   • 后续处理不当：如果警方在登记员工信息后，未妥善保管这些信息，导致信息泄露或被滥用，那么警方也可能需要承担相应的法律责任。

3. 员工应如何应对：

   • 配合调查：在警方要求登记员工信息时，员工应首先确认警方的身份和登记目的，如果确认是合法调查，应积极配合提供必要的信息。
   • 保护隐私：员工有权保护自己的个人隐私，如果警方要求提供的信息超出了必要范围或涉及个人隐私，员工可以拒绝提供或要求警方说明理由。
   • 寻求法律帮助：如果员工认为警方的登记行为违法或侵犯了自己的权益，可以及时向律师咨询并寻求法律帮助。

4. 店铺老板的责任：

   • 虽然店铺老板不在现场，但如果员工因登记信息而遭受了不当对待或权益受损，店铺老板作为雇主，在一定程度上也可能需要承担相应的责任，如提供必要的支持和协助员工维护权益等。

建议：在实际操作中，如果客户报警店铺但老板不在，警方要求登记员工信息，员工应首先确认警方的身份和登记目的，并积极配合提供必要的信息。同时，员工也有权保护自己的个人隐私，如果认为警方的要求不合理或侵犯了自己的权益，可以及时向律师咨询并寻求法律帮助。如果有任何疑问或需要进一步的法律指导，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。