事业单位虚构劳动关系属于违法行为，需承担行政责任、民事责任，情节严重的还可能承担刑事责任，具体处理方式需根据实际情况判断。以下从不同法律责任角度展开分析：

一、行政责任

1. 劳动保障监察处理
   根据《劳动保障监察条例》第三十条，事业单位若通过伪造材料、虚构用工事实等方式骗取社会保险待遇或逃避缴费义务，劳动保障行政部门将责令改正，并处以2000元以上2万元以下罚款。若涉及骗取社会保险基金，还需退还违法所得，并可能面临更高额度的罚款。

2. 事业单位人事管理处罚
   若虚构劳动关系用于套取财政资金、编制名额或规避人事管理规定，可能违反《事业单位人事管理条例》第二十八条。主管部门可对直接责任人员给予警告、记过、降级、撤职或开除处分，并责令单位限期整改。

二、民事责任

1. 劳动者权益救济
   若虚构劳动关系导致劳动者无法享受工伤待遇、失业保险等权益，劳动者可依据《劳动合同法》第九十八条，要求事业单位赔偿实际损失（如医疗费、伤残补助金等）。若涉及未签订书面劳动合同，劳动者还可主张双倍工资差额。

2. 第三方权益冲突
   若虚构劳动关系侵害第三方权益（如冒用他人身份参保），第三方可依据《民法典》第一百二十二条，要求事业单位返还不当得利，并赔偿因身份被冒用导致的损失（如信用受损、社保权益冲突等）。

三、刑事责任

1. 诈骗罪
   若事业单位通过虚构劳动关系骗取社会保险基金、财政补贴等公共财产，数额较大（通常为3000元至1万元以上），可能构成《刑法》第二百六十六条规定的诈骗罪。单位直接负责的主管人员和其他直接责任人员将面临三年以下有期徒刑、拘役或管制，并处或单处罚金；数额巨大或特别巨大的，刑罚将升至三年以上十年以下有期徒刑或十年以上有期徒刑或无期徒刑。

2. 滥用职权罪/玩忽职守罪
   若事业单位工作人员利用职务便利虚构劳动关系，导致公共财产、国家和人民利益遭受重大损失，可能构成《刑法》第三百九十七条规定的滥用职权罪或玩忽职守罪。情节特别严重的，可处三年以上七年以下有期徒刑。

四、实务建议

1. 对事业单位：立即停止虚构行为，主动向劳动保障部门或主管部门坦白，退还违法所得，配合调查以争取从轻处理。
2. 对劳动者：保留工资条、考勤记录、工作证等证据，通过劳动仲裁或诉讼主张权益；若发现身份被冒用，及时向公安机关报案并联系社保部门冻结账户。
3. 对第三方：若身份被冒用，可要求事业单位出具书面说明，并向社保部门申请更正参保信息；若因此遭受损失，可同步提起民事诉讼索赔。

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