农村房屋倒塌的鉴定与赔偿部门需根据倒塌原因来确定，以下是不同情况下的具体分析：

1. 因自然灾害导致房屋倒塌

   • 鉴定与申请部门：首先，这类情况通常不需要专门的部门进行倒塌原因的鉴定，因为自然灾害（如地震、洪水等）是显而易见的原因。农户应直接向当地村委会提出灾害救助申请，由村委会上报至乡镇政府进行审核。
   • 赔偿流程：最终由县级民政部门根据灾害严重程度和农户损失情况，按照相关政策和程序进行审批，并发放救助金。这些救助可能包括临时生活救助和倒房重建补助等。

2. 因房屋被认定为危房且自行拆除或整治导致的损失

   • 鉴定部门：若房屋被鉴定为危房，这通常是由住房和城乡建设部门或其指定的专业机构进行的。农户在收到危房鉴定通知后，需按照要求进行拆除或整治。
   • 赔偿与补助：相关部门会负责组织危房鉴定、制定改造计划，并根据政策发放相应的资金补助。农户应联系住房和城乡建设部门或当地政府指定的农村危房改造主管部门获取补偿。

3. 因征收拆迁导致房屋需要拆除

   • 鉴定与协商部门：在征收拆迁过程中，房屋倒塌（或拆除）的原因通常是明确的，即为了公共利益进行的征收。农户应与土地管理部门或房屋征收部门协商补偿事宜。
   • 赔偿流程：征收部门会按照相关法律法规和征收补偿方案给予合理补偿。被征收人可与征收部门就补偿事宜进行协商，如对补偿决定不服，可通过法律途径维护自己的合法权益，包括但不限于行政复议或行政诉讼。

4. 因他人侵权行为导致房屋损坏甚至倒塌

   • 鉴定与协商：若房屋损坏是由他人侵权行为（如施工导致地基受损、邻里纠纷导致的破坏等）造成，首先应尝试与侵权人进行协商，寻求赔偿。在此过程中，如果需要，可以聘请专业机构对房屋倒塌的原因进行鉴定，以明确责任。
   • 调解与诉讼：协商不成时，可向当地建设部门申请调解，或直接向法院提起诉讼以维护自身权益。在此过程中，应保留好相关证据，如照片、视频、证人证言等，以便在调解或诉讼中使用。

总结与建议：

• 农户在遇到房屋倒塌情况时，应首先明确倒塌原因，这有助于确定应向哪个部门申请赔偿或救助。
• 在与相关部门或侵权人协商赔偿事宜时，应保留好相关证据，以便在需要时证明自己的权益。
• 如果对赔偿事宜有疑问或不满，可以及时咨询我，我会根据具体情况提供专业的法律建议和支持。