撞死人后即使双方私了达成了民事赔偿协议，公安机关仍然会依法进行刑事立案处理。以下是对此问题的详细分析：
刑事责任不可通过私了免除
- 法律依据：根据《中华人民共和国刑法》第一百三十三条的规定，违反交通运输管理法规，因而发生重大事故，致人重伤、死亡或者使公私财产遭受重大损失的，构成交通肇事罪。这一罪行属于公诉案件，由国家公诉机关即人民检察院代表国家追究犯罪嫌疑人的刑事责任。
- 公诉案件性质：交通肇事罪作为公诉案件，其刑事责任不能通过当事人的协商而私了。即使双方在民事赔偿上达成了一致，也不能免除肇事者可能面临的刑事责任。这是因为刑事责任涉及对社会的公共利益和秩序的维护，不能因个人之间的协议而免除。
私了不影响刑事立案程序
- 立案必要性：根据《道路交通事故处理程序规定》，造成人员死亡的交通事故必须立即报警，不能私下协商解决。这意味着，无论双方是否达成私了协议，警方都有责任和义务对事故进行调查，并根据调查结果决定是否立案。
- 立案流程：公安机关交通管理部门在接到报案后，应当对事故进行记录，并在三日内作出是否接受案件的决定。经核查道路交通事故事实存在的，应当受理并制作受案登记表；无法证明事实存在或不属于其管辖范围的，应书面告知当事人并说明理由。
私了协议的作用与限制
- 积极作用：虽然私了协议不能免除刑事责任，但在民事赔偿方面，它仍然是有效的。双方达成的赔偿协议可以作为后续司法程序中的参考，特别是在量刑阶段，法院可能会考虑犯罪嫌疑人积极赔偿、取得谅解等情节，从而给予从轻处罚。
- 法律限制：私了协议不能违反法律法规的强制性规定，也不能损害国家、集体或第三人的合法权益。否则，该协议将被视为无效或部分无效。例如，如果私了协议中约定的赔偿金额远低于实际损失，或者协议中包含了违法的内容，那么这样的协议是不会被法律认可的。
建议与后果：
- 及时报警：在发生交通事故导致人员死亡的情况下，肇事者应立即报警并配合警方的调查处理。试图通过私了来逃避刑事责任是不可取的，也是违法的。
- 积极赔偿：虽然私了协议不能免除刑事责任，但积极赔偿受害者家属并取得其谅解，可以在量刑阶段作为从轻处罚的情节考虑。
- 法律后果：如果肇事者被认定构成交通肇事罪，将面临三年以下有期徒刑或者拘役的刑事处罚。如果肇事后逃逸或者有其他特别恶劣情节的，处罚将更加严厉。
综上所述，撞死人后即使双方私了达成了民事赔偿协议，公安机关仍然会依法进行刑事立案处理。因此，在面临此类情况时，建议当事人及时报警并配合警方的调查处理，同时积极与受害者家属协商赔偿事宜。如果有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。