针对您提出的“违章建筑评估公司评估后怎么处理”的问题，这通常涉及多个环节和部门，且具体处理方式可能因地区和政策的不同而有所差异。以下是一个基于一般流程和政策原则的详细解答：
一、评估目的与结果应用
首先，违章建筑评估公司的主要任务是对违章建筑进行专业评估，确定其价值、结构安全性、对周边环境的影响等。评估结果通常作为后续处理决策的重要依据，包括但不限于补缴地价、罚款、拆除或整改等。
二、具体处理方式
补缴地价：
- 在某些地区，如深圳市，对于生产经营性历史违建或商业、办公类历史违建，若申请办理为商品性质，需按照市场评估地价的一定比例（如50%或全额）补缴地价。
- 补缴地价时，可能还需考虑年期修正、楼层修正等因素，具体依据当地的地价测算规则执行。
罚款与整改：
- 对于违章建筑，相关部门可能会根据违法情节的轻重，对建设者或所有者处以罚款。
- 同时，要求建设者或所有者对违章建筑进行整改，如拆除部分违章结构、恢复原状或达到安全标准等。
拆除：
- 对于严重违反规划、影响公共安全或无法通过整改达到安全标准的违章建筑，相关部门可能会依法作出拆除决定。
- 拆除前，通常会给予建设者或所有者一定的期限进行自行拆除或申请行政复议/诉讼。
- 若逾期未拆除，相关部门将依法组织强制拆除。
其他处理方式：
- 在某些特殊情况下，如违章建筑具有历史价值或文化意义，相关部门可能会考虑采取其他处理方式，如保留并改造利用、纳入保护范围等。
三、处理流程
评估与认定：
- 违章建筑评估公司进行专业评估，并出具评估报告。
- 相关部门根据评估报告和法律法规，对违章建筑进行认定。
通知与听证：
- 相关部门向建设者或所有者发出处理通知，告知其违章事实、处理意见和法律依据。
- 在必要时，组织听证会，听取建设者或所有者的陈述和申辩。
作出处理决定：
- 相关部门根据评估结果、认定意见和听证情况，作出处理决定。
执行与监督：
- 建设者或所有者按照处理决定执行，如补缴地价、罚款、整改或拆除等。
- 相关部门对执行情况进行监督，确保处理决定得到有效落实。
四、地区差异与政策依据
需要注意的是，不同地区对违章建筑的处理方式和政策可能存在差异。例如，深圳市和蚌埠市在违章建筑处理方面就有各自的具体规定和操作流程。因此，在处理违章建筑时，应参考当地的相关法律法规和政策文件，确保处理方式的合法性和有效性。
五、建议与咨询
若您对违章建筑的处理方式存在疑问或需要进一步的咨询，建议您：
- 查阅当地的相关法律法规和政策文件，了解具体的处理规定和流程。
- 咨询当地的规划、自然资源、城市管理等相关部门，获取专业的指导和建议。
- 在必要时，寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。
希望以上解答能对您有所帮助。如有其他问题或需要进一步的咨询，请随时告知。