结论：在承包经营期间以矿业公司名义办理的采矿许可证，在合同无效后，其归属问题需根据具体情况判断，一般原则上归属于矿业公司，但也可能因合同具体约定、实际投入及过错情况等因素产生变化。
分析说明：
采矿许可证的法定归属原则：
- 采矿许可证是矿业权人依法取得的对矿产资源进行开采的法定凭证。根据相关法律法规，采矿许可证的办理通常是以矿业公司名义进行，且矿业权一般归属于矿业公司。
- 在承包经营期间，虽然承包方可能实际进行开采活动，但采矿许可证的办理和持有主体并未因此改变，仍应为矿业公司。
合同无效对采矿许可证归属的影响：
- 合同无效意味着双方之间的权利义务关系自始不存在或无效。然而，这并不直接导致采矿许可证的归属发生变化。
- 采矿许可证的归属更多取决于矿业权的法定归属和合同中的具体约定，而非合同的效力状态。
合同具体约定对采矿许可证归属的影响：
- 如果合同中明确约定了承包经营期间采矿许可证的归属或使用方式，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么应按照合同约定处理。
- 例如，合同可能约定承包经营期间采矿许可证由承包方使用，但所有权仍归矿业公司；或者约定在特定条件下采矿许可证可转让给承包方等。
实际投入及过错情况对采矿许可证归属的潜在影响：
- 如果承包方在承包经营期间对采矿许可证的取得或维持投入了大量资金或资源，且矿业公司对此存在过错（如未履行协助义务等），那么承包方可能主张一定的权益。
- 但这种情况下，承包方通常只能主张因投入而产生的补偿或赔偿，而非直接取得采矿许可证的所有权。
法律建议：
- 在处理此类问题时，首先应查阅并分析相关合同条款，明确双方对采矿许可证的归属或使用方式的约定。
- 如果合同未明确约定或约定不明确，应依据相关法律法规和矿业权的法定归属原则进行判断。
- 考虑到实际投入及过错情况可能对采矿许可证归属产生的潜在影响，建议双方在协商或诉讼过程中充分举证和辩论，以维护自身合法权益。
后续行动建议：
- 如果双方对采矿许可证的归属存在争议，且无法通过协商解决，建议及时寻求法律途径解决，如提起诉讼或申请仲裁。
- 在处理争议过程中，应注意收集并保存相关证据材料，如合同文本、投入凭证、过错证明等，以支持自身主张。
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