公司公章被别人拿去盖了，其法律效力需根据具体情况来判断。以下是从不同角度进行的详细分析：
一、具有法律效力的情形
善意第三人情形：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，如果善意第三人基于对公章公信力的合理信赖，与公司签订了合同或从事了其他法律行为，且该行为符合正常商业交往流程，那么公司原则上需承担相应法律责任。例如，公司与供应商签订采购合同，若供应商不知公章被他人拿去盖，且合同条款符合市场交易习惯，公司不能以公章被他人拿去盖为由拒绝履行义务。
公司内部管理瑕疵情形：
- 如果公司内部管理存在瑕疵，如公章保管不善、使用审批程序不严格等，导致公章被他人拿去盖，而相对方在交易中并无过错，那么公司也可能需要承担法律责任。因为公司有义务确保公章的安全使用，避免给相对方造成误解或损失。
二、不具有法律效力的情形
相对方存在恶意情形：
- 若能证明相对方明知或应知公章被他人拿去盖，即非善意，则该盖章行为对公司不具约束力。例如，相对方与偷盖公章者恶意串通，损害公司利益，此时签订的合同无效。
能证明偷盖事实且相对方存在重大过失情形：
- 公司有充分证据证明公章被他人拿去盖，且能证明相对方在交易中存在重大过失，如未按照正常审核流程确认盖章行为的合法性，也可能推翻相关法律文件的效力。此外，若合同内容对公司明显不利或与公司业务完全不符，也可作为辅助证据。
三、应对措施与建议
及时收集证据：
- 发现公章被他人拿去盖后，公司应立即采取措施收集证据，如查看监控录像、保留相关文件等，以证明公章被他人拿去盖的事实。这些证据在后续可能的法律纠纷中至关重要。
报警处理：
- 如果相关行为涉嫌刑事犯罪，如盗窃罪、诈骗罪等，公司应及时向公安机关报案。这不仅有助于追究犯罪者的刑事责任，还能在后续可能的民事纠纷中作为有力证据。
加强内部管理：
- 公司应加强对公章的保管和使用审批程序，确保公章的安全使用。例如，可以设立专门的公章保管人员，对公章的使用进行严格审批和登记。
法律途径解决：
- 如果因公章被他人拿去盖而产生了法律纠纷，公司应及时通过法律途径解决。可以向我咨询具体的法律策略和建议，以便更好地维护自身权益。
总结来说，公司公章被别人拿去盖了，其法律效力需根据具体情况来判断。公司应及时采取措施收集证据、报警处理并加强内部管理，以维护自身权益。如果遇到法律纠纷，可以直接向我咨询具体的法律策略和建议。